Protein–RNA interactions for Protein: Q96L96

ALPK3, Alpha-protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPK3Q96L96 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ALPK3Q96L96 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ALPK3Q96L96 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ALPK3Q96L96 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ALPK3Q96L96 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ALPK3Q96L96 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ALPK3Q96L96 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ALPK3Q96L96 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ALPK3Q96L96 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ALPK3Q96L96 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ALPK3Q96L96 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ALPK3Q96L96 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ALPK3Q96L96 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ALPK3Q96L96 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALPK3Q96L96 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALPK3Q96L96 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALPK3Q96L96 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALPK3Q96L96 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALPK3Q96L96 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALPK3Q96L96 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALPK3Q96L96 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALPK3Q96L96 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALPK3Q96L96 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALPK3Q96L96 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALPK3Q96L96 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALPK3Q96L96 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALPK3Q96L96 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALPK3Q96L96 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALPK3Q96L96 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALPK3Q96L96 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALPK3Q96L96 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALPK3Q96L96 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALPK3Q96L96 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ALPK3Q96L96 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALPK3Q96L96 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALPK3Q96L96 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALPK3Q96L96 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALPK3Q96L96 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALPK3Q96L96 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALPK3Q96L96 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ALPK3Q96L96 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALPK3Q96L96 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ALPK3Q96L96 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
ALPK3Q96L96 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ALPK3Q96L96 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ALPK3Q96L96 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ALPK3Q96L96 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ALPK3Q96L96 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ALPK3Q96L96 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ALPK3Q96L96 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ALPK3Q96L96 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALPK3Q96L96 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALPK3Q96L96 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALPK3Q96L96 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALPK3Q96L96 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALPK3Q96L96 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALPK3Q96L96 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALPK3Q96L96 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALPK3Q96L96 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALPK3Q96L96 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ALPK3Q96L96 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALPK3Q96L96 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALPK3Q96L96 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALPK3Q96L96 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ALPK3Q96L96 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ALPK3Q96L96 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ALPK3Q96L96 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ALPK3Q96L96 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ALPK3Q96L96 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ALPK3Q96L96 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ALPK3Q96L96 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ALPK3Q96L96 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ALPK3Q96L96 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ALPK3Q96L96 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ALPK3Q96L96 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ALPK3Q96L96 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ALPK3Q96L96 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ALPK3Q96L96 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ALPK3Q96L96 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ALPK3Q96L96 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALPK3Q96L96 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALPK3Q96L96 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALPK3Q96L96 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALPK3Q96L96 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALPK3Q96L96 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALPK3Q96L96 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALPK3Q96L96 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ALPK3Q96L96 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALPK3Q96L96 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALPK3Q96L96 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ALPK3Q96L96 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALPK3Q96L96 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ALPK3Q96L96 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALPK3Q96L96 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALPK3Q96L96 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALPK3Q96L96 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALPK3Q96L96 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALPK3Q96L96 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALPK3Q96L96 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALPK3Q96L96 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms