Protein–RNA interactions for Protein: Q96L46

CAPNS2, Calpain small subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS2Q96L46 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAPNS2Q96L46 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAPNS2Q96L46 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAPNS2Q96L46 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPNS2Q96L46 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPNS2Q96L46 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPNS2Q96L46 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPNS2Q96L46 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPNS2Q96L46 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPNS2Q96L46 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPNS2Q96L46 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPNS2Q96L46 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPNS2Q96L46 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPNS2Q96L46 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPNS2Q96L46 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPNS2Q96L46 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPNS2Q96L46 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPNS2Q96L46 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPNS2Q96L46 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPNS2Q96L46 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPNS2Q96L46 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPNS2Q96L46 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPNS2Q96L46 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPNS2Q96L46 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPNS2Q96L46 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPNS2Q96L46 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPNS2Q96L46 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPNS2Q96L46 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPNS2Q96L46 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPNS2Q96L46 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPNS2Q96L46 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPNS2Q96L46 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPNS2Q96L46 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPNS2Q96L46 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPNS2Q96L46 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPNS2Q96L46 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPNS2Q96L46 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPNS2Q96L46 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPNS2Q96L46 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPNS2Q96L46 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPNS2Q96L46 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPNS2Q96L46 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPNS2Q96L46 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPNS2Q96L46 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPNS2Q96L46 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPNS2Q96L46 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPNS2Q96L46 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPNS2Q96L46 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPNS2Q96L46 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPNS2Q96L46 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPNS2Q96L46 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPNS2Q96L46 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPNS2Q96L46 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPNS2Q96L46 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPNS2Q96L46 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPNS2Q96L46 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPNS2Q96L46 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPNS2Q96L46 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPNS2Q96L46 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPNS2Q96L46 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPNS2Q96L46 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPNS2Q96L46 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPNS2Q96L46 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPNS2Q96L46 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPNS2Q96L46 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPNS2Q96L46 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPNS2Q96L46 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPNS2Q96L46 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPNS2Q96L46 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPNS2Q96L46 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPNS2Q96L46 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPNS2Q96L46 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPNS2Q96L46 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPNS2Q96L46 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPNS2Q96L46 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPNS2Q96L46 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPNS2Q96L46 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPNS2Q96L46 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPNS2Q96L46 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPNS2Q96L46 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPNS2Q96L46 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPNS2Q96L46 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPNS2Q96L46 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPNS2Q96L46 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAPNS2Q96L46 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAPNS2Q96L46 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAPNS2Q96L46 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAPNS2Q96L46 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAPNS2Q96L46 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAPNS2Q96L46 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAPNS2Q96L46 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CAPNS2Q96L46 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAPNS2Q96L46 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAPNS2Q96L46 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAPNS2Q96L46 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAPNS2Q96L46 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAPNS2Q96L46 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAPNS2Q96L46 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPNS2Q96L46 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPNS2Q96L46 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms