Protein–RNA interactions for Protein: Q96L08

SUSD3, Sushi domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD3Q96L08 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SUSD3Q96L08 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SUSD3Q96L08 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SUSD3Q96L08 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SUSD3Q96L08 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SUSD3Q96L08 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SUSD3Q96L08 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SUSD3Q96L08 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUSD3Q96L08 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUSD3Q96L08 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUSD3Q96L08 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUSD3Q96L08 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUSD3Q96L08 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUSD3Q96L08 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUSD3Q96L08 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUSD3Q96L08 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUSD3Q96L08 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUSD3Q96L08 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUSD3Q96L08 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUSD3Q96L08 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUSD3Q96L08 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUSD3Q96L08 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUSD3Q96L08 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUSD3Q96L08 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUSD3Q96L08 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUSD3Q96L08 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUSD3Q96L08 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUSD3Q96L08 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUSD3Q96L08 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUSD3Q96L08 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SUSD3Q96L08 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SUSD3Q96L08 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SUSD3Q96L08 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SUSD3Q96L08 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SUSD3Q96L08 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SUSD3Q96L08 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SUSD3Q96L08 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SUSD3Q96L08 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SUSD3Q96L08 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SUSD3Q96L08 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SUSD3Q96L08 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SUSD3Q96L08 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SUSD3Q96L08 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SUSD3Q96L08 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SUSD3Q96L08 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SUSD3Q96L08 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SUSD3Q96L08 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SUSD3Q96L08 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SUSD3Q96L08 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SUSD3Q96L08 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SUSD3Q96L08 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SUSD3Q96L08 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SUSD3Q96L08 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SUSD3Q96L08 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SUSD3Q96L08 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SUSD3Q96L08 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SUSD3Q96L08 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SUSD3Q96L08 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SUSD3Q96L08 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SUSD3Q96L08 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SUSD3Q96L08 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SUSD3Q96L08 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SUSD3Q96L08 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SUSD3Q96L08 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SUSD3Q96L08 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SUSD3Q96L08 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SUSD3Q96L08 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SUSD3Q96L08 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SUSD3Q96L08 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SUSD3Q96L08 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SUSD3Q96L08 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SUSD3Q96L08 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SUSD3Q96L08 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SUSD3Q96L08 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SUSD3Q96L08 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SUSD3Q96L08 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SUSD3Q96L08 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SUSD3Q96L08 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SUSD3Q96L08 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SUSD3Q96L08 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SUSD3Q96L08 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUSD3Q96L08 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUSD3Q96L08 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUSD3Q96L08 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUSD3Q96L08 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUSD3Q96L08 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUSD3Q96L08 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUSD3Q96L08 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUSD3Q96L08 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUSD3Q96L08 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUSD3Q96L08 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUSD3Q96L08 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUSD3Q96L08 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUSD3Q96L08 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUSD3Q96L08 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUSD3Q96L08 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUSD3Q96L08 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUSD3Q96L08 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUSD3Q96L08 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUSD3Q96L08 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms