Protein–RNA interactions for Protein: Q96L03

SPATA17, Spermatogenesis-associated protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA17Q96L03 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPATA17Q96L03 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPATA17Q96L03 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPATA17Q96L03 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPATA17Q96L03 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SPATA17Q96L03 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SPATA17Q96L03 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPATA17Q96L03 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPATA17Q96L03 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPATA17Q96L03 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPATA17Q96L03 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPATA17Q96L03 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPATA17Q96L03 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPATA17Q96L03 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPATA17Q96L03 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPATA17Q96L03 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPATA17Q96L03 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPATA17Q96L03 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPATA17Q96L03 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPATA17Q96L03 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPATA17Q96L03 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPATA17Q96L03 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPATA17Q96L03 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPATA17Q96L03 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPATA17Q96L03 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPATA17Q96L03 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPATA17Q96L03 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPATA17Q96L03 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPATA17Q96L03 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPATA17Q96L03 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPATA17Q96L03 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPATA17Q96L03 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPATA17Q96L03 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPATA17Q96L03 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SPATA17Q96L03 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SPATA17Q96L03 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPATA17Q96L03 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPATA17Q96L03 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPATA17Q96L03 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SPATA17Q96L03 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPATA17Q96L03 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPATA17Q96L03 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SPATA17Q96L03 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SPATA17Q96L03 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SPATA17Q96L03 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPATA17Q96L03 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPATA17Q96L03 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPATA17Q96L03 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SPATA17Q96L03 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPATA17Q96L03 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPATA17Q96L03 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPATA17Q96L03 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPATA17Q96L03 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPATA17Q96L03 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPATA17Q96L03 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPATA17Q96L03 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPATA17Q96L03 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPATA17Q96L03 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPATA17Q96L03 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPATA17Q96L03 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPATA17Q96L03 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPATA17Q96L03 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPATA17Q96L03 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPATA17Q96L03 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPATA17Q96L03 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPATA17Q96L03 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPATA17Q96L03 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPATA17Q96L03 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPATA17Q96L03 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SPATA17Q96L03 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPATA17Q96L03 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPATA17Q96L03 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPATA17Q96L03 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPATA17Q96L03 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPATA17Q96L03 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPATA17Q96L03 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPATA17Q96L03 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPATA17Q96L03 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SPATA17Q96L03 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPATA17Q96L03 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPATA17Q96L03 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPATA17Q96L03 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPATA17Q96L03 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPATA17Q96L03 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPATA17Q96L03 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPATA17Q96L03 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPATA17Q96L03 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPATA17Q96L03 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPATA17Q96L03 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPATA17Q96L03 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPATA17Q96L03 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPATA17Q96L03 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPATA17Q96L03 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPATA17Q96L03 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPATA17Q96L03 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPATA17Q96L03 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPATA17Q96L03 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPATA17Q96L03 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPATA17Q96L03 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPATA17Q96L03 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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