Protein–RNA interactions for Protein: Q96KK3

KCNS1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS1Q96KK3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNS1Q96KK3 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNS1Q96KK3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNS1Q96KK3 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNS1Q96KK3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNS1Q96KK3 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNS1Q96KK3 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNS1Q96KK3 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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KCNS1Q96KK3 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNS1Q96KK3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KCNS1Q96KK3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNS1Q96KK3 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNS1Q96KK3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNS1Q96KK3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNS1Q96KK3 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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KCNS1Q96KK3 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNS1Q96KK3 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNS1Q96KK3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNS1Q96KK3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNS1Q96KK3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KCNS1Q96KK3 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KCNS1Q96KK3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KCNS1Q96KK3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
KCNS1Q96KK3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KCNS1Q96KK3 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KCNS1Q96KK3 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KCNS1Q96KK3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KCNS1Q96KK3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KCNS1Q96KK3 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KCNS1Q96KK3 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KCNS1Q96KK3 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KCNS1Q96KK3 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNS1Q96KK3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNS1Q96KK3 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNS1Q96KK3 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNS1Q96KK3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNS1Q96KK3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNS1Q96KK3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KCNS1Q96KK3 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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KCNS1Q96KK3 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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KCNS1Q96KK3 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNS1Q96KK3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KCNS1Q96KK3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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KCNS1Q96KK3 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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KCNS1Q96KK3 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNS1Q96KK3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNS1Q96KK3 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNS1Q96KK3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNS1Q96KK3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNS1Q96KK3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNS1Q96KK3 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNS1Q96KK3 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KCNS1Q96KK3 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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