Protein–RNA interactions for Protein: Q96K49

TMEM87B, Transmembrane protein 87B, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM87BQ96K49 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM87BQ96K49 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM87BQ96K49 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM87BQ96K49 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM87BQ96K49 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM87BQ96K49 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM87BQ96K49 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM87BQ96K49 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM87BQ96K49 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM87BQ96K49 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM87BQ96K49 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM87BQ96K49 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM87BQ96K49 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM87BQ96K49 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM87BQ96K49 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM87BQ96K49 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM87BQ96K49 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM87BQ96K49 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM87BQ96K49 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM87BQ96K49 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM87BQ96K49 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM87BQ96K49 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM87BQ96K49 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM87BQ96K49 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM87BQ96K49 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM87BQ96K49 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM87BQ96K49 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM87BQ96K49 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM87BQ96K49 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM87BQ96K49 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM87BQ96K49 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM87BQ96K49 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM87BQ96K49 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM87BQ96K49 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM87BQ96K49 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM87BQ96K49 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM87BQ96K49 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM87BQ96K49 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM87BQ96K49 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM87BQ96K49 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM87BQ96K49 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM87BQ96K49 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM87BQ96K49 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM87BQ96K49 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM87BQ96K49 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM87BQ96K49 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM87BQ96K49 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM87BQ96K49 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM87BQ96K49 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM87BQ96K49 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM87BQ96K49 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM87BQ96K49 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM87BQ96K49 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM87BQ96K49 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM87BQ96K49 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM87BQ96K49 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM87BQ96K49 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM87BQ96K49 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM87BQ96K49 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM87BQ96K49 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM87BQ96K49 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM87BQ96K49 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM87BQ96K49 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM87BQ96K49 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM87BQ96K49 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM87BQ96K49 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM87BQ96K49 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM87BQ96K49 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM87BQ96K49 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM87BQ96K49 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM87BQ96K49 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM87BQ96K49 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM87BQ96K49 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM87BQ96K49 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM87BQ96K49 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM87BQ96K49 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM87BQ96K49 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM87BQ96K49 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM87BQ96K49 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM87BQ96K49 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM87BQ96K49 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM87BQ96K49 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM87BQ96K49 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM87BQ96K49 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM87BQ96K49 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM87BQ96K49 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM87BQ96K49 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM87BQ96K49 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM87BQ96K49 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM87BQ96K49 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM87BQ96K49 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM87BQ96K49 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM87BQ96K49 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM87BQ96K49 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM87BQ96K49 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM87BQ96K49 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM87BQ96K49 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM87BQ96K49 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM87BQ96K49 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM87BQ96K49 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms