Protein–RNA interactions for Protein: Q96JJ7

TMX3, Protein disulfide-isomerase TMX3, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX3Q96JJ7 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMX3Q96JJ7 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMX3Q96JJ7 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMX3Q96JJ7 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMX3Q96JJ7 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMX3Q96JJ7 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMX3Q96JJ7 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMX3Q96JJ7 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TMX3Q96JJ7 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TMX3Q96JJ7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TMX3Q96JJ7 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TMX3Q96JJ7 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMX3Q96JJ7 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TMX3Q96JJ7 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMX3Q96JJ7 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMX3Q96JJ7 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMX3Q96JJ7 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMX3Q96JJ7 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMX3Q96JJ7 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TMX3Q96JJ7 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMX3Q96JJ7 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMX3Q96JJ7 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMX3Q96JJ7 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TMX3Q96JJ7 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TMX3Q96JJ7 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMX3Q96JJ7 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMX3Q96JJ7 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMX3Q96JJ7 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMX3Q96JJ7 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMX3Q96JJ7 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMX3Q96JJ7 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMX3Q96JJ7 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMX3Q96JJ7 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMX3Q96JJ7 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMX3Q96JJ7 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMX3Q96JJ7 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMX3Q96JJ7 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMX3Q96JJ7 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMX3Q96JJ7 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMX3Q96JJ7 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMX3Q96JJ7 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMX3Q96JJ7 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMX3Q96JJ7 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMX3Q96JJ7 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TMX3Q96JJ7 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TMX3Q96JJ7 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMX3Q96JJ7 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMX3Q96JJ7 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMX3Q96JJ7 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMX3Q96JJ7 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMX3Q96JJ7 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMX3Q96JJ7 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMX3Q96JJ7 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMX3Q96JJ7 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMX3Q96JJ7 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMX3Q96JJ7 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMX3Q96JJ7 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMX3Q96JJ7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMX3Q96JJ7 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMX3Q96JJ7 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMX3Q96JJ7 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMX3Q96JJ7 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMX3Q96JJ7 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TMX3Q96JJ7 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMX3Q96JJ7 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMX3Q96JJ7 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMX3Q96JJ7 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMX3Q96JJ7 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMX3Q96JJ7 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMX3Q96JJ7 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMX3Q96JJ7 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMX3Q96JJ7 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TMX3Q96JJ7 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMX3Q96JJ7 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMX3Q96JJ7 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMX3Q96JJ7 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMX3Q96JJ7 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TMX3Q96JJ7 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMX3Q96JJ7 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMX3Q96JJ7 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMX3Q96JJ7 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMX3Q96JJ7 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMX3Q96JJ7 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMX3Q96JJ7 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMX3Q96JJ7 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMX3Q96JJ7 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMX3Q96JJ7 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMX3Q96JJ7 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMX3Q96JJ7 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMX3Q96JJ7 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TMX3Q96JJ7 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMX3Q96JJ7 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMX3Q96JJ7 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMX3Q96JJ7 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMX3Q96JJ7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMX3Q96JJ7 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMX3Q96JJ7 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMX3Q96JJ7 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMX3Q96JJ7 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMX3Q96JJ7 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms