Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
COG3Q96JB2 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
COG3Q96JB2 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
COG3Q96JB2 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
COG3Q96JB2 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
COG3Q96JB2 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
COG3Q96JB2 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
COG3Q96JB2 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
COG3Q96JB2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
COG3Q96JB2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
COG3Q96JB2 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
COG3Q96JB2 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
COG3Q96JB2 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
COG3Q96JB2 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
COG3Q96JB2 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
COG3Q96JB2 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
COG3Q96JB2 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
COG3Q96JB2 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
COG3Q96JB2 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
COG3Q96JB2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
COG3Q96JB2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
COG3Q96JB2 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
COG3Q96JB2 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
COG3Q96JB2 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
COG3Q96JB2 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
COG3Q96JB2 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
COG3Q96JB2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
COG3Q96JB2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
COG3Q96JB2 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
COG3Q96JB2 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
COG3Q96JB2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
COG3Q96JB2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
COG3Q96JB2 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
COG3Q96JB2 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
COG3Q96JB2 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
COG3Q96JB2 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
COG3Q96JB2 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
COG3Q96JB2 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
COG3Q96JB2 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
COG3Q96JB2 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
COG3Q96JB2 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
COG3Q96JB2 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
COG3Q96JB2 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
COG3Q96JB2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
COG3Q96JB2 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
COG3Q96JB2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
COG3Q96JB2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
COG3Q96JB2 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
COG3Q96JB2 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
COG3Q96JB2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
COG3Q96JB2 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
COG3Q96JB2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
COG3Q96JB2 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
COG3Q96JB2 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
COG3Q96JB2 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
COG3Q96JB2 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
COG3Q96JB2 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
COG3Q96JB2 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
COG3Q96JB2 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
COG3Q96JB2 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
COG3Q96JB2 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
COG3Q96JB2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
COG3Q96JB2 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
COG3Q96JB2 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
COG3Q96JB2 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
COG3Q96JB2 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
COG3Q96JB2 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
COG3Q96JB2 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
COG3Q96JB2 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
COG3Q96JB2 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
COG3Q96JB2 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
COG3Q96JB2 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
COG3Q96JB2 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
COG3Q96JB2 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
COG3Q96JB2 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
COG3Q96JB2 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
COG3Q96JB2 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
COG3Q96JB2 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
COG3Q96JB2 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
COG3Q96JB2 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
COG3Q96JB2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
COG3Q96JB2 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
COG3Q96JB2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
COG3Q96JB2 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
COG3Q96JB2 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
COG3Q96JB2 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
COG3Q96JB2 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
COG3Q96JB2 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
COG3Q96JB2 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
COG3Q96JB2 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
COG3Q96JB2 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
COG3Q96JB2 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
COG3Q96JB2 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
COG3Q96JB2 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
COG3Q96JB2 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
COG3Q96JB2 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
COG3Q96JB2 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
COG3Q96JB2 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
COG3Q96JB2 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
COG3Q96JB2 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms