Protein–RNA interactions for Protein: Q96J66

ABCC11, ATP-binding cassette sub-family C member 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC11Q96J66 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
ABCC11Q96J66 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
ABCC11Q96J66 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
ABCC11Q96J66 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
ABCC11Q96J66 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
ABCC11Q96J66 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
ABCC11Q96J66 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
ABCC11Q96J66 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
ABCC11Q96J66 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
ABCC11Q96J66 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ABCC11Q96J66 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ABCC11Q96J66 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ABCC11Q96J66 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
ABCC11Q96J66 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ABCC11Q96J66 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ABCC11Q96J66 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ABCC11Q96J66 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ABCC11Q96J66 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ABCC11Q96J66 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ABCC11Q96J66 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ABCC11Q96J66 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
ABCC11Q96J66 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ABCC11Q96J66 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ABCC11Q96J66 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ABCC11Q96J66 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ABCC11Q96J66 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ABCC11Q96J66 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ABCC11Q96J66 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ABCC11Q96J66 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ABCC11Q96J66 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ABCC11Q96J66 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ABCC11Q96J66 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ABCC11Q96J66 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ABCC11Q96J66 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ABCC11Q96J66 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ABCC11Q96J66 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ABCC11Q96J66 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ABCC11Q96J66 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ABCC11Q96J66 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ABCC11Q96J66 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
ABCC11Q96J66 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ABCC11Q96J66 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ABCC11Q96J66 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ABCC11Q96J66 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ABCC11Q96J66 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ABCC11Q96J66 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ABCC11Q96J66 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ABCC11Q96J66 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ABCC11Q96J66 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ABCC11Q96J66 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ABCC11Q96J66 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ABCC11Q96J66 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ABCC11Q96J66 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ABCC11Q96J66 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ABCC11Q96J66 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ABCC11Q96J66 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ABCC11Q96J66 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ABCC11Q96J66 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ABCC11Q96J66 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ABCC11Q96J66 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ABCC11Q96J66 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ABCC11Q96J66 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ABCC11Q96J66 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ABCC11Q96J66 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
ABCC11Q96J66 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ABCC11Q96J66 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ABCC11Q96J66 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ABCC11Q96J66 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ABCC11Q96J66 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ABCC11Q96J66 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ABCC11Q96J66 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ABCC11Q96J66 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ABCC11Q96J66 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ABCC11Q96J66 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
ABCC11Q96J66 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ABCC11Q96J66 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
ABCC11Q96J66 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
ABCC11Q96J66 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ABCC11Q96J66 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ABCC11Q96J66 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ABCC11Q96J66 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ABCC11Q96J66 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ABCC11Q96J66 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ABCC11Q96J66 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ABCC11Q96J66 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ABCC11Q96J66 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ABCC11Q96J66 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ABCC11Q96J66 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ABCC11Q96J66 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ABCC11Q96J66 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ABCC11Q96J66 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ABCC11Q96J66 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ABCC11Q96J66 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ABCC11Q96J66 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ABCC11Q96J66 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ABCC11Q96J66 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ABCC11Q96J66 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ABCC11Q96J66 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
ABCC11Q96J66 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
ABCC11Q96J66 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms