Protein–RNA interactions for Protein: Q96G01

BICD1, Protein bicaudal D homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BICD1Q96G01 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BICD1Q96G01 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BICD1Q96G01 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BICD1Q96G01 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BICD1Q96G01 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BICD1Q96G01 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
BICD1Q96G01 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
BICD1Q96G01 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BICD1Q96G01 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BICD1Q96G01 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
BICD1Q96G01 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
BICD1Q96G01 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BICD1Q96G01 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BICD1Q96G01 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BICD1Q96G01 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BICD1Q96G01 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
BICD1Q96G01 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BICD1Q96G01 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BICD1Q96G01 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BICD1Q96G01 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BICD1Q96G01 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BICD1Q96G01 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BICD1Q96G01 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BICD1Q96G01 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BICD1Q96G01 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BICD1Q96G01 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BICD1Q96G01 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BICD1Q96G01 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BICD1Q96G01 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BICD1Q96G01 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BICD1Q96G01 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BICD1Q96G01 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BICD1Q96G01 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BICD1Q96G01 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BICD1Q96G01 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BICD1Q96G01 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BICD1Q96G01 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BICD1Q96G01 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BICD1Q96G01 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BICD1Q96G01 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BICD1Q96G01 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BICD1Q96G01 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BICD1Q96G01 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BICD1Q96G01 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BICD1Q96G01 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BICD1Q96G01 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BICD1Q96G01 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
BICD1Q96G01 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
BICD1Q96G01 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BICD1Q96G01 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BICD1Q96G01 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BICD1Q96G01 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BICD1Q96G01 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BICD1Q96G01 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BICD1Q96G01 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BICD1Q96G01 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BICD1Q96G01 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BICD1Q96G01 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BICD1Q96G01 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BICD1Q96G01 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BICD1Q96G01 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BICD1Q96G01 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BICD1Q96G01 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BICD1Q96G01 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BICD1Q96G01 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BICD1Q96G01 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
BICD1Q96G01 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BICD1Q96G01 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BICD1Q96G01 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BICD1Q96G01 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BICD1Q96G01 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BICD1Q96G01 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BICD1Q96G01 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
BICD1Q96G01 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BICD1Q96G01 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BICD1Q96G01 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BICD1Q96G01 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BICD1Q96G01 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BICD1Q96G01 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BICD1Q96G01 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BICD1Q96G01 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BICD1Q96G01 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BICD1Q96G01 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BICD1Q96G01 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BICD1Q96G01 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BICD1Q96G01 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BICD1Q96G01 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BICD1Q96G01 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BICD1Q96G01 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
BICD1Q96G01 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BICD1Q96G01 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
BICD1Q96G01 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
BICD1Q96G01 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
BICD1Q96G01 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BICD1Q96G01 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BICD1Q96G01 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BICD1Q96G01 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BICD1Q96G01 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BICD1Q96G01 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BICD1Q96G01 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms