Protein–RNA interactions for Protein: Q96EA4

SPDL1, Protein Spindly, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDL1Q96EA4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPDL1Q96EA4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SPDL1Q96EA4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPDL1Q96EA4 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPDL1Q96EA4 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPDL1Q96EA4 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPDL1Q96EA4 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPDL1Q96EA4 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPDL1Q96EA4 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPDL1Q96EA4 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPDL1Q96EA4 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPDL1Q96EA4 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPDL1Q96EA4 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPDL1Q96EA4 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPDL1Q96EA4 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPDL1Q96EA4 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPDL1Q96EA4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPDL1Q96EA4 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPDL1Q96EA4 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPDL1Q96EA4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPDL1Q96EA4 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPDL1Q96EA4 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPDL1Q96EA4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SPDL1Q96EA4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SPDL1Q96EA4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPDL1Q96EA4 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SPDL1Q96EA4 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPDL1Q96EA4 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPDL1Q96EA4 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPDL1Q96EA4 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPDL1Q96EA4 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SPDL1Q96EA4 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPDL1Q96EA4 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPDL1Q96EA4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPDL1Q96EA4 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPDL1Q96EA4 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPDL1Q96EA4 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPDL1Q96EA4 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPDL1Q96EA4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPDL1Q96EA4 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPDL1Q96EA4 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPDL1Q96EA4 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SPDL1Q96EA4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPDL1Q96EA4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPDL1Q96EA4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPDL1Q96EA4 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPDL1Q96EA4 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPDL1Q96EA4 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPDL1Q96EA4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPDL1Q96EA4 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPDL1Q96EA4 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPDL1Q96EA4 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPDL1Q96EA4 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPDL1Q96EA4 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPDL1Q96EA4 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPDL1Q96EA4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPDL1Q96EA4 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPDL1Q96EA4 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPDL1Q96EA4 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPDL1Q96EA4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SPDL1Q96EA4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPDL1Q96EA4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPDL1Q96EA4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPDL1Q96EA4 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPDL1Q96EA4 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPDL1Q96EA4 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPDL1Q96EA4 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SPDL1Q96EA4 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPDL1Q96EA4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPDL1Q96EA4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPDL1Q96EA4 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPDL1Q96EA4 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPDL1Q96EA4 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPDL1Q96EA4 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPDL1Q96EA4 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPDL1Q96EA4 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPDL1Q96EA4 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPDL1Q96EA4 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPDL1Q96EA4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPDL1Q96EA4 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPDL1Q96EA4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPDL1Q96EA4 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPDL1Q96EA4 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPDL1Q96EA4 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPDL1Q96EA4 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPDL1Q96EA4 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPDL1Q96EA4 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPDL1Q96EA4 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SPDL1Q96EA4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPDL1Q96EA4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPDL1Q96EA4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPDL1Q96EA4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPDL1Q96EA4 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPDL1Q96EA4 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPDL1Q96EA4 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPDL1Q96EA4 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPDL1Q96EA4 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPDL1Q96EA4 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPDL1Q96EA4 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPDL1Q96EA4 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms