Protein–RNA interactions for Protein: Q96DU9

PABPC5, Polyadenylate-binding protein 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC5Q96DU9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PABPC5Q96DU9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PABPC5Q96DU9 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PABPC5Q96DU9 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PABPC5Q96DU9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PABPC5Q96DU9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PABPC5Q96DU9 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PABPC5Q96DU9 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PABPC5Q96DU9 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PABPC5Q96DU9 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PABPC5Q96DU9 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PABPC5Q96DU9 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PABPC5Q96DU9 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PABPC5Q96DU9 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PABPC5Q96DU9 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PABPC5Q96DU9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PABPC5Q96DU9 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PABPC5Q96DU9 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PABPC5Q96DU9 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PABPC5Q96DU9 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PABPC5Q96DU9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PABPC5Q96DU9 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PABPC5Q96DU9 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PABPC5Q96DU9 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PABPC5Q96DU9 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PABPC5Q96DU9 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PABPC5Q96DU9 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PABPC5Q96DU9 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PABPC5Q96DU9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PABPC5Q96DU9 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PABPC5Q96DU9 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PABPC5Q96DU9 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PABPC5Q96DU9 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PABPC5Q96DU9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PABPC5Q96DU9 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PABPC5Q96DU9 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PABPC5Q96DU9 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PABPC5Q96DU9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PABPC5Q96DU9 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PABPC5Q96DU9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PABPC5Q96DU9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PABPC5Q96DU9 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PABPC5Q96DU9 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PABPC5Q96DU9 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PABPC5Q96DU9 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PABPC5Q96DU9 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PABPC5Q96DU9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PABPC5Q96DU9 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PABPC5Q96DU9 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PABPC5Q96DU9 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PABPC5Q96DU9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PABPC5Q96DU9 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PABPC5Q96DU9 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PABPC5Q96DU9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PABPC5Q96DU9 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PABPC5Q96DU9 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PABPC5Q96DU9 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PABPC5Q96DU9 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PABPC5Q96DU9 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PABPC5Q96DU9 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PABPC5Q96DU9 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PABPC5Q96DU9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PABPC5Q96DU9 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PABPC5Q96DU9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PABPC5Q96DU9 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PABPC5Q96DU9 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PABPC5Q96DU9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PABPC5Q96DU9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PABPC5Q96DU9 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PABPC5Q96DU9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PABPC5Q96DU9 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PABPC5Q96DU9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PABPC5Q96DU9 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PABPC5Q96DU9 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PABPC5Q96DU9 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PABPC5Q96DU9 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PABPC5Q96DU9 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PABPC5Q96DU9 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PABPC5Q96DU9 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PABPC5Q96DU9 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PABPC5Q96DU9 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PABPC5Q96DU9 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PABPC5Q96DU9 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PABPC5Q96DU9 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PABPC5Q96DU9 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PABPC5Q96DU9 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PABPC5Q96DU9 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PABPC5Q96DU9 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PABPC5Q96DU9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PABPC5Q96DU9 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PABPC5Q96DU9 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PABPC5Q96DU9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PABPC5Q96DU9 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PABPC5Q96DU9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PABPC5Q96DU9 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PABPC5Q96DU9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PABPC5Q96DU9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PABPC5Q96DU9 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PABPC5Q96DU9 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PABPC5Q96DU9 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms