Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC9

OTUB2, Ubiquitin thioesterase OTUB2, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUB2Q96DC9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
OTUB2Q96DC9 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OTUB2Q96DC9 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OTUB2Q96DC9 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
OTUB2Q96DC9 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
OTUB2Q96DC9 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
OTUB2Q96DC9 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
OTUB2Q96DC9 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
OTUB2Q96DC9 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
OTUB2Q96DC9 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
OTUB2Q96DC9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OTUB2Q96DC9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OTUB2Q96DC9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OTUB2Q96DC9 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OTUB2Q96DC9 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OTUB2Q96DC9 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OTUB2Q96DC9 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
OTUB2Q96DC9 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
OTUB2Q96DC9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
OTUB2Q96DC9 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
OTUB2Q96DC9 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
OTUB2Q96DC9 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
OTUB2Q96DC9 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.3■■□□□ 1
OTUB2Q96DC9 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
OTUB2Q96DC9 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
OTUB2Q96DC9 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
OTUB2Q96DC9 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
OTUB2Q96DC9 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
OTUB2Q96DC9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
OTUB2Q96DC9 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
OTUB2Q96DC9 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
OTUB2Q96DC9 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
OTUB2Q96DC9 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
OTUB2Q96DC9 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
OTUB2Q96DC9 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OTUB2Q96DC9 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OTUB2Q96DC9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
OTUB2Q96DC9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
OTUB2Q96DC9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OTUB2Q96DC9 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OTUB2Q96DC9 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
OTUB2Q96DC9 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
OTUB2Q96DC9 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OTUB2Q96DC9 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OTUB2Q96DC9 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OTUB2Q96DC9 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
OTUB2Q96DC9 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
OTUB2Q96DC9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OTUB2Q96DC9 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
OTUB2Q96DC9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OTUB2Q96DC9 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OTUB2Q96DC9 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OTUB2Q96DC9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OTUB2Q96DC9 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OTUB2Q96DC9 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OTUB2Q96DC9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OTUB2Q96DC9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OTUB2Q96DC9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
OTUB2Q96DC9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
OTUB2Q96DC9 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.28■■□□□ 1
OTUB2Q96DC9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OTUB2Q96DC9 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OTUB2Q96DC9 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OTUB2Q96DC9 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OTUB2Q96DC9 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OTUB2Q96DC9 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
OTUB2Q96DC9 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
OTUB2Q96DC9 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
OTUB2Q96DC9 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
OTUB2Q96DC9 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OTUB2Q96DC9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OTUB2Q96DC9 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OTUB2Q96DC9 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OTUB2Q96DC9 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
OTUB2Q96DC9 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OTUB2Q96DC9 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OTUB2Q96DC9 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
OTUB2Q96DC9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
OTUB2Q96DC9 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
OTUB2Q96DC9 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
OTUB2Q96DC9 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
OTUB2Q96DC9 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.27■■□□□ 1
OTUB2Q96DC9 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
OTUB2Q96DC9 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
OTUB2Q96DC9 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
OTUB2Q96DC9 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
OTUB2Q96DC9 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.27■■□□□ 1
OTUB2Q96DC9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
OTUB2Q96DC9 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
OTUB2Q96DC9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
OTUB2Q96DC9 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
OTUB2Q96DC9 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
OTUB2Q96DC9 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
OTUB2Q96DC9 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
OTUB2Q96DC9 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
OTUB2Q96DC9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
OTUB2Q96DC9 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
OTUB2Q96DC9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
OTUB2Q96DC9 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
OTUB2Q96DC9 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms