Protein–RNA interactions for Protein: Q96A29

SLC35C1, GDP-fucose transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35C1Q96A29 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC35C1Q96A29 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC35C1Q96A29 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC35C1Q96A29 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC35C1Q96A29 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC35C1Q96A29 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC35C1Q96A29 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC35C1Q96A29 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC35C1Q96A29 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC35C1Q96A29 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC35C1Q96A29 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC35C1Q96A29 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC35C1Q96A29 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC35C1Q96A29 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC35C1Q96A29 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC35C1Q96A29 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC35C1Q96A29 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC35C1Q96A29 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC35C1Q96A29 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC35C1Q96A29 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC35C1Q96A29 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC35C1Q96A29 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC35C1Q96A29 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC35C1Q96A29 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC35C1Q96A29 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC35C1Q96A29 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC35C1Q96A29 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC35C1Q96A29 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC35C1Q96A29 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC35C1Q96A29 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC35C1Q96A29 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC35C1Q96A29 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC35C1Q96A29 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC35C1Q96A29 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC35C1Q96A29 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC35C1Q96A29 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC35C1Q96A29 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC35C1Q96A29 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC35C1Q96A29 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC35C1Q96A29 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC35C1Q96A29 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC35C1Q96A29 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC35C1Q96A29 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC35C1Q96A29 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC35C1Q96A29 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC35C1Q96A29 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC35C1Q96A29 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC35C1Q96A29 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC35C1Q96A29 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC35C1Q96A29 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC35C1Q96A29 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC35C1Q96A29 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC35C1Q96A29 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC35C1Q96A29 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC35C1Q96A29 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC35C1Q96A29 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC35C1Q96A29 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC35C1Q96A29 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC35C1Q96A29 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC35C1Q96A29 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC35C1Q96A29 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC35C1Q96A29 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC35C1Q96A29 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC35C1Q96A29 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC35C1Q96A29 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC35C1Q96A29 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC35C1Q96A29 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC35C1Q96A29 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC35C1Q96A29 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC35C1Q96A29 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC35C1Q96A29 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC35C1Q96A29 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC35C1Q96A29 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC35C1Q96A29 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC35C1Q96A29 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC35C1Q96A29 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC35C1Q96A29 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC35C1Q96A29 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC35C1Q96A29 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC35C1Q96A29 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC35C1Q96A29 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC35C1Q96A29 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC35C1Q96A29 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC35C1Q96A29 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC35C1Q96A29 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC35C1Q96A29 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC35C1Q96A29 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC35C1Q96A29 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC35C1Q96A29 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC35C1Q96A29 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC35C1Q96A29 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC35C1Q96A29 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC35C1Q96A29 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC35C1Q96A29 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC35C1Q96A29 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC35C1Q96A29 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC35C1Q96A29 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC35C1Q96A29 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC35C1Q96A29 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC35C1Q96A29 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms