Protein–RNA interactions for Protein: Q969X6

UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4Q969X6 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
UTP4Q969X6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UTP4Q969X6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20■□□□□ 0.79
UTP4Q969X6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
UTP4Q969X6 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UTP4Q969X6 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UTP4Q969X6 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UTP4Q969X6 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
UTP4Q969X6 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UTP4Q969X6 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UTP4Q969X6 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UTP4Q969X6 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UTP4Q969X6 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UTP4Q969X6 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UTP4Q969X6 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UTP4Q969X6 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UTP4Q969X6 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UTP4Q969X6 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UTP4Q969X6 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UTP4Q969X6 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UTP4Q969X6 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UTP4Q969X6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UTP4Q969X6 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UTP4Q969X6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
UTP4Q969X6 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UTP4Q969X6 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UTP4Q969X6 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UTP4Q969X6 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UTP4Q969X6 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UTP4Q969X6 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UTP4Q969X6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UTP4Q969X6 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UTP4Q969X6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UTP4Q969X6 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UTP4Q969X6 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UTP4Q969X6 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UTP4Q969X6 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UTP4Q969X6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UTP4Q969X6 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UTP4Q969X6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UTP4Q969X6 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UTP4Q969X6 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UTP4Q969X6 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UTP4Q969X6 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UTP4Q969X6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UTP4Q969X6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UTP4Q969X6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UTP4Q969X6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UTP4Q969X6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UTP4Q969X6 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UTP4Q969X6 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UTP4Q969X6 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UTP4Q969X6 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UTP4Q969X6 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UTP4Q969X6 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UTP4Q969X6 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UTP4Q969X6 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UTP4Q969X6 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UTP4Q969X6 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UTP4Q969X6 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UTP4Q969X6 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UTP4Q969X6 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UTP4Q969X6 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UTP4Q969X6 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UTP4Q969X6 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UTP4Q969X6 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UTP4Q969X6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
UTP4Q969X6 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UTP4Q969X6 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UTP4Q969X6 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UTP4Q969X6 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UTP4Q969X6 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UTP4Q969X6 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UTP4Q969X6 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UTP4Q969X6 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UTP4Q969X6 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UTP4Q969X6 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UTP4Q969X6 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UTP4Q969X6 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
UTP4Q969X6 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UTP4Q969X6 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UTP4Q969X6 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
UTP4Q969X6 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UTP4Q969X6 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
UTP4Q969X6 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UTP4Q969X6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UTP4Q969X6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UTP4Q969X6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
UTP4Q969X6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
UTP4Q969X6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UTP4Q969X6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UTP4Q969X6 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UTP4Q969X6 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UTP4Q969X6 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
UTP4Q969X6 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
UTP4Q969X6 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UTP4Q969X6 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UTP4Q969X6 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UTP4Q969X6 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UTP4Q969X6 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms