Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAVIN3Q969G5 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAVIN3Q969G5 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAVIN3Q969G5 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAVIN3Q969G5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAVIN3Q969G5 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAVIN3Q969G5 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAVIN3Q969G5 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAVIN3Q969G5 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAVIN3Q969G5 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAVIN3Q969G5 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAVIN3Q969G5 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAVIN3Q969G5 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAVIN3Q969G5 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAVIN3Q969G5 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAVIN3Q969G5 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAVIN3Q969G5 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAVIN3Q969G5 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAVIN3Q969G5 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAVIN3Q969G5 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAVIN3Q969G5 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAVIN3Q969G5 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAVIN3Q969G5 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAVIN3Q969G5 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAVIN3Q969G5 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAVIN3Q969G5 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAVIN3Q969G5 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAVIN3Q969G5 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CAVIN3Q969G5 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CAVIN3Q969G5 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CAVIN3Q969G5 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CAVIN3Q969G5 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CAVIN3Q969G5 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CAVIN3Q969G5 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAVIN3Q969G5 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAVIN3Q969G5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAVIN3Q969G5 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAVIN3Q969G5 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAVIN3Q969G5 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAVIN3Q969G5 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CAVIN3Q969G5 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAVIN3Q969G5 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAVIN3Q969G5 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAVIN3Q969G5 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAVIN3Q969G5 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAVIN3Q969G5 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAVIN3Q969G5 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAVIN3Q969G5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAVIN3Q969G5 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CAVIN3Q969G5 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CAVIN3Q969G5 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAVIN3Q969G5 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAVIN3Q969G5 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CAVIN3Q969G5 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CAVIN3Q969G5 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CAVIN3Q969G5 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAVIN3Q969G5 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAVIN3Q969G5 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CAVIN3Q969G5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAVIN3Q969G5 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CAVIN3Q969G5 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CAVIN3Q969G5 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAVIN3Q969G5 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAVIN3Q969G5 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAVIN3Q969G5 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CAVIN3Q969G5 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAVIN3Q969G5 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CAVIN3Q969G5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CAVIN3Q969G5 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CAVIN3Q969G5 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CAVIN3Q969G5 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CAVIN3Q969G5 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CAVIN3Q969G5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CAVIN3Q969G5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CAVIN3Q969G5 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CAVIN3Q969G5 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CAVIN3Q969G5 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CAVIN3Q969G5 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CAVIN3Q969G5 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CAVIN3Q969G5 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CAVIN3Q969G5 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAVIN3Q969G5 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAVIN3Q969G5 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAVIN3Q969G5 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CAVIN3Q969G5 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CAVIN3Q969G5 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CAVIN3Q969G5 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAVIN3Q969G5 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAVIN3Q969G5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CAVIN3Q969G5 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CAVIN3Q969G5 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAVIN3Q969G5 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAVIN3Q969G5 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAVIN3Q969G5 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAVIN3Q969G5 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CAVIN3Q969G5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CAVIN3Q969G5 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CAVIN3Q969G5 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CAVIN3Q969G5 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CAVIN3Q969G5 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms