Protein–RNA interactions for Protein: Q969F9

HPS3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3Q969F9 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HPS3Q969F9 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HPS3Q969F9 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HPS3Q969F9 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HPS3Q969F9 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HPS3Q969F9 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
HPS3Q969F9 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HPS3Q969F9 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
HPS3Q969F9 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HPS3Q969F9 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HPS3Q969F9 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HPS3Q969F9 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HPS3Q969F9 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HPS3Q969F9 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HPS3Q969F9 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
HPS3Q969F9 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HPS3Q969F9 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HPS3Q969F9 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HPS3Q969F9 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HPS3Q969F9 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HPS3Q969F9 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HPS3Q969F9 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HPS3Q969F9 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HPS3Q969F9 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HPS3Q969F9 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HPS3Q969F9 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HPS3Q969F9 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HPS3Q969F9 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HPS3Q969F9 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HPS3Q969F9 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HPS3Q969F9 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HPS3Q969F9 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HPS3Q969F9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HPS3Q969F9 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HPS3Q969F9 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HPS3Q969F9 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HPS3Q969F9 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HPS3Q969F9 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HPS3Q969F9 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HPS3Q969F9 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HPS3Q969F9 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HPS3Q969F9 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HPS3Q969F9 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HPS3Q969F9 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HPS3Q969F9 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HPS3Q969F9 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HPS3Q969F9 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HPS3Q969F9 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HPS3Q969F9 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HPS3Q969F9 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HPS3Q969F9 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HPS3Q969F9 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HPS3Q969F9 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HPS3Q969F9 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HPS3Q969F9 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HPS3Q969F9 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HPS3Q969F9 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HPS3Q969F9 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HPS3Q969F9 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HPS3Q969F9 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HPS3Q969F9 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HPS3Q969F9 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HPS3Q969F9 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HPS3Q969F9 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HPS3Q969F9 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HPS3Q969F9 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HPS3Q969F9 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HPS3Q969F9 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HPS3Q969F9 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HPS3Q969F9 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HPS3Q969F9 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HPS3Q969F9 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HPS3Q969F9 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HPS3Q969F9 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HPS3Q969F9 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HPS3Q969F9 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HPS3Q969F9 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HPS3Q969F9 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HPS3Q969F9 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HPS3Q969F9 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HPS3Q969F9 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HPS3Q969F9 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23■■□□□ 1.27
HPS3Q969F9 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HPS3Q969F9 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HPS3Q969F9 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HPS3Q969F9 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HPS3Q969F9 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HPS3Q969F9 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HPS3Q969F9 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HPS3Q969F9 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HPS3Q969F9 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HPS3Q969F9 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
HPS3Q969F9 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23■■□□□ 1.27
HPS3Q969F9 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HPS3Q969F9 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HPS3Q969F9 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HPS3Q969F9 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HPS3Q969F9 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HPS3Q969F9 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HPS3Q969F9 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms