Protein–RNA interactions for Protein: Q92994

BRF1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1Q92994 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRF1Q92994 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRF1Q92994 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRF1Q92994 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
BRF1Q92994 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRF1Q92994 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRF1Q92994 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRF1Q92994 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRF1Q92994 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRF1Q92994 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRF1Q92994 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRF1Q92994 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRF1Q92994 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRF1Q92994 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRF1Q92994 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRF1Q92994 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
BRF1Q92994 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
BRF1Q92994 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRF1Q92994 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
BRF1Q92994 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRF1Q92994 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
BRF1Q92994 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
BRF1Q92994 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
BRF1Q92994 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
BRF1Q92994 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BRF1Q92994 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BRF1Q92994 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BRF1Q92994 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BRF1Q92994 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BRF1Q92994 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
BRF1Q92994 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BRF1Q92994 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BRF1Q92994 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
BRF1Q92994 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BRF1Q92994 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BRF1Q92994 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BRF1Q92994 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BRF1Q92994 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BRF1Q92994 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BRF1Q92994 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BRF1Q92994 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRF1Q92994 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRF1Q92994 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRF1Q92994 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRF1Q92994 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRF1Q92994 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRF1Q92994 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRF1Q92994 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRF1Q92994 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRF1Q92994 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRF1Q92994 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRF1Q92994 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRF1Q92994 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRF1Q92994 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRF1Q92994 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRF1Q92994 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRF1Q92994 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
BRF1Q92994 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRF1Q92994 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRF1Q92994 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRF1Q92994 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRF1Q92994 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRF1Q92994 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRF1Q92994 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRF1Q92994 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRF1Q92994 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRF1Q92994 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRF1Q92994 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRF1Q92994 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRF1Q92994 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRF1Q92994 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRF1Q92994 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRF1Q92994 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRF1Q92994 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRF1Q92994 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRF1Q92994 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRF1Q92994 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRF1Q92994 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRF1Q92994 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRF1Q92994 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRF1Q92994 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
BRF1Q92994 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRF1Q92994 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRF1Q92994 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRF1Q92994 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRF1Q92994 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRF1Q92994 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRF1Q92994 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRF1Q92994 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRF1Q92994 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRF1Q92994 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRF1Q92994 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
BRF1Q92994 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRF1Q92994 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRF1Q92994 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRF1Q92994 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRF1Q92994 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRF1Q92994 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRF1Q92994 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRF1Q92994 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms