Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEJ3

SH3RF3, SH3 domain-containing RING finger protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3RF3Q8TEJ3 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SH3RF3Q8TEJ3 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SH3RF3Q8TEJ3 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SH3RF3Q8TEJ3 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SH3RF3Q8TEJ3 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SH3RF3Q8TEJ3 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SH3RF3Q8TEJ3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SH3RF3Q8TEJ3 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SH3RF3Q8TEJ3 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SH3RF3Q8TEJ3 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SH3RF3Q8TEJ3 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SH3RF3Q8TEJ3 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SH3RF3Q8TEJ3 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SH3RF3Q8TEJ3 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SH3RF3Q8TEJ3 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SH3RF3Q8TEJ3 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SH3RF3Q8TEJ3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SH3RF3Q8TEJ3 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SH3RF3Q8TEJ3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SH3RF3Q8TEJ3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SH3RF3Q8TEJ3 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SH3RF3Q8TEJ3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SH3RF3Q8TEJ3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SH3RF3Q8TEJ3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SH3RF3Q8TEJ3 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SH3RF3Q8TEJ3 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SH3RF3Q8TEJ3 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SH3RF3Q8TEJ3 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SH3RF3Q8TEJ3 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SH3RF3Q8TEJ3 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SH3RF3Q8TEJ3 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SH3RF3Q8TEJ3 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SH3RF3Q8TEJ3 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SH3RF3Q8TEJ3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SH3RF3Q8TEJ3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SH3RF3Q8TEJ3 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SH3RF3Q8TEJ3 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SH3RF3Q8TEJ3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SH3RF3Q8TEJ3 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SH3RF3Q8TEJ3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SH3RF3Q8TEJ3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SH3RF3Q8TEJ3 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SH3RF3Q8TEJ3 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SH3RF3Q8TEJ3 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SH3RF3Q8TEJ3 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SH3RF3Q8TEJ3 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SH3RF3Q8TEJ3 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SH3RF3Q8TEJ3 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SH3RF3Q8TEJ3 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SH3RF3Q8TEJ3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SH3RF3Q8TEJ3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SH3RF3Q8TEJ3 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SH3RF3Q8TEJ3 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SH3RF3Q8TEJ3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SH3RF3Q8TEJ3 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SH3RF3Q8TEJ3 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SH3RF3Q8TEJ3 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SH3RF3Q8TEJ3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SH3RF3Q8TEJ3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SH3RF3Q8TEJ3 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SH3RF3Q8TEJ3 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SH3RF3Q8TEJ3 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SH3RF3Q8TEJ3 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SH3RF3Q8TEJ3 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SH3RF3Q8TEJ3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SH3RF3Q8TEJ3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SH3RF3Q8TEJ3 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SH3RF3Q8TEJ3 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SH3RF3Q8TEJ3 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SH3RF3Q8TEJ3 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SH3RF3Q8TEJ3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SH3RF3Q8TEJ3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SH3RF3Q8TEJ3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SH3RF3Q8TEJ3 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SH3RF3Q8TEJ3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SH3RF3Q8TEJ3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SH3RF3Q8TEJ3 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SH3RF3Q8TEJ3 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SH3RF3Q8TEJ3 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SH3RF3Q8TEJ3 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SH3RF3Q8TEJ3 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SH3RF3Q8TEJ3 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SH3RF3Q8TEJ3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SH3RF3Q8TEJ3 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SH3RF3Q8TEJ3 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SH3RF3Q8TEJ3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SH3RF3Q8TEJ3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SH3RF3Q8TEJ3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SH3RF3Q8TEJ3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SH3RF3Q8TEJ3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SH3RF3Q8TEJ3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SH3RF3Q8TEJ3 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SH3RF3Q8TEJ3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SH3RF3Q8TEJ3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SH3RF3Q8TEJ3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SH3RF3Q8TEJ3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SH3RF3Q8TEJ3 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SH3RF3Q8TEJ3 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SH3RF3Q8TEJ3 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SH3RF3Q8TEJ3 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms