Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBG9

SYNPR, Synaptoporin, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPRQ8TBG9 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNPRQ8TBG9 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNPRQ8TBG9 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNPRQ8TBG9 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNPRQ8TBG9 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNPRQ8TBG9 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNPRQ8TBG9 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNPRQ8TBG9 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNPRQ8TBG9 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNPRQ8TBG9 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNPRQ8TBG9 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNPRQ8TBG9 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNPRQ8TBG9 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNPRQ8TBG9 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNPRQ8TBG9 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNPRQ8TBG9 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNPRQ8TBG9 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNPRQ8TBG9 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNPRQ8TBG9 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNPRQ8TBG9 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNPRQ8TBG9 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNPRQ8TBG9 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYNPRQ8TBG9 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNPRQ8TBG9 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNPRQ8TBG9 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNPRQ8TBG9 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNPRQ8TBG9 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNPRQ8TBG9 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNPRQ8TBG9 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNPRQ8TBG9 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNPRQ8TBG9 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNPRQ8TBG9 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNPRQ8TBG9 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNPRQ8TBG9 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNPRQ8TBG9 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNPRQ8TBG9 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNPRQ8TBG9 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNPRQ8TBG9 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNPRQ8TBG9 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNPRQ8TBG9 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNPRQ8TBG9 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNPRQ8TBG9 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYNPRQ8TBG9 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNPRQ8TBG9 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNPRQ8TBG9 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNPRQ8TBG9 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNPRQ8TBG9 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNPRQ8TBG9 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNPRQ8TBG9 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNPRQ8TBG9 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNPRQ8TBG9 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNPRQ8TBG9 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNPRQ8TBG9 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNPRQ8TBG9 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNPRQ8TBG9 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNPRQ8TBG9 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNPRQ8TBG9 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNPRQ8TBG9 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNPRQ8TBG9 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNPRQ8TBG9 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYNPRQ8TBG9 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNPRQ8TBG9 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNPRQ8TBG9 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNPRQ8TBG9 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNPRQ8TBG9 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNPRQ8TBG9 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNPRQ8TBG9 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNPRQ8TBG9 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNPRQ8TBG9 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNPRQ8TBG9 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNPRQ8TBG9 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNPRQ8TBG9 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNPRQ8TBG9 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNPRQ8TBG9 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNPRQ8TBG9 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNPRQ8TBG9 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNPRQ8TBG9 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNPRQ8TBG9 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNPRQ8TBG9 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNPRQ8TBG9 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNPRQ8TBG9 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNPRQ8TBG9 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNPRQ8TBG9 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNPRQ8TBG9 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNPRQ8TBG9 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYNPRQ8TBG9 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYNPRQ8TBG9 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYNPRQ8TBG9 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYNPRQ8TBG9 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYNPRQ8TBG9 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYNPRQ8TBG9 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYNPRQ8TBG9 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYNPRQ8TBG9 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYNPRQ8TBG9 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYNPRQ8TBG9 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYNPRQ8TBG9 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYNPRQ8TBG9 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYNPRQ8TBG9 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYNPRQ8TBG9 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYNPRQ8TBG9 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms