Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG06

TRIM58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, humanhuman

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM58Q8NG06 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM58Q8NG06 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM58Q8NG06 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM58Q8NG06 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM58Q8NG06 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM58Q8NG06 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM58Q8NG06 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM58Q8NG06 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM58Q8NG06 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM58Q8NG06 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM58Q8NG06 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM58Q8NG06 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM58Q8NG06 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM58Q8NG06 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM58Q8NG06 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM58Q8NG06 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM58Q8NG06 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM58Q8NG06 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM58Q8NG06 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM58Q8NG06 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM58Q8NG06 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM58Q8NG06 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM58Q8NG06 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM58Q8NG06 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM58Q8NG06 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM58Q8NG06 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM58Q8NG06 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM58Q8NG06 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM58Q8NG06 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM58Q8NG06 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM58Q8NG06 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM58Q8NG06 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM58Q8NG06 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM58Q8NG06 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM58Q8NG06 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM58Q8NG06 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM58Q8NG06 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM58Q8NG06 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM58Q8NG06 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM58Q8NG06 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM58Q8NG06 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM58Q8NG06 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM58Q8NG06 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM58Q8NG06 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM58Q8NG06 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM58Q8NG06 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM58Q8NG06 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM58Q8NG06 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM58Q8NG06 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM58Q8NG06 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM58Q8NG06 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM58Q8NG06 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM58Q8NG06 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM58Q8NG06 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM58Q8NG06 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM58Q8NG06 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM58Q8NG06 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM58Q8NG06 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM58Q8NG06 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM58Q8NG06 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM58Q8NG06 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM58Q8NG06 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM58Q8NG06 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM58Q8NG06 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM58Q8NG06 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM58Q8NG06 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM58Q8NG06 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM58Q8NG06 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM58Q8NG06 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM58Q8NG06 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM58Q8NG06 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM58Q8NG06 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM58Q8NG06 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM58Q8NG06 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM58Q8NG06 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM58Q8NG06 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM58Q8NG06 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM58Q8NG06 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM58Q8NG06 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRIM58Q8NG06 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRIM58Q8NG06 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM58Q8NG06 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM58Q8NG06 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM58Q8NG06 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM58Q8NG06 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM58Q8NG06 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM58Q8NG06 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM58Q8NG06 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM58Q8NG06 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM58Q8NG06 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM58Q8NG06 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM58Q8NG06 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM58Q8NG06 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM58Q8NG06 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM58Q8NG06 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM58Q8NG06 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM58Q8NG06 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM58Q8NG06 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM58Q8NG06 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM58Q8NG06 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms