Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU1

CCDC197, Putative uncharacterized protein CCDC197, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC197Q8NCU1 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CCDC197Q8NCU1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CCDC197Q8NCU1 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CCDC197Q8NCU1 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC197Q8NCU1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC197Q8NCU1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC197Q8NCU1 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC197Q8NCU1 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC197Q8NCU1 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC197Q8NCU1 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC197Q8NCU1 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC197Q8NCU1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC197Q8NCU1 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC197Q8NCU1 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC197Q8NCU1 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC197Q8NCU1 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC197Q8NCU1 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC197Q8NCU1 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC197Q8NCU1 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC197Q8NCU1 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC197Q8NCU1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC197Q8NCU1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC197Q8NCU1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC197Q8NCU1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC197Q8NCU1 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC197Q8NCU1 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC197Q8NCU1 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC197Q8NCU1 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC197Q8NCU1 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC197Q8NCU1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC197Q8NCU1 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC197Q8NCU1 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC197Q8NCU1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC197Q8NCU1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC197Q8NCU1 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC197Q8NCU1 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC197Q8NCU1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC197Q8NCU1 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC197Q8NCU1 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC197Q8NCU1 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC197Q8NCU1 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC197Q8NCU1 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC197Q8NCU1 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC197Q8NCU1 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC197Q8NCU1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC197Q8NCU1 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC197Q8NCU1 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC197Q8NCU1 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC197Q8NCU1 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC197Q8NCU1 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC197Q8NCU1 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC197Q8NCU1 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC197Q8NCU1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC197Q8NCU1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC197Q8NCU1 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC197Q8NCU1 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC197Q8NCU1 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC197Q8NCU1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC197Q8NCU1 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC197Q8NCU1 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC197Q8NCU1 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC197Q8NCU1 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC197Q8NCU1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC197Q8NCU1 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC197Q8NCU1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC197Q8NCU1 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC197Q8NCU1 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC197Q8NCU1 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC197Q8NCU1 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC197Q8NCU1 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC197Q8NCU1 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC197Q8NCU1 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC197Q8NCU1 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC197Q8NCU1 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC197Q8NCU1 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC197Q8NCU1 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC197Q8NCU1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC197Q8NCU1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC197Q8NCU1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC197Q8NCU1 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC197Q8NCU1 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC197Q8NCU1 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC197Q8NCU1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC197Q8NCU1 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC197Q8NCU1 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC197Q8NCU1 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC197Q8NCU1 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC197Q8NCU1 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC197Q8NCU1 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC197Q8NCU1 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC197Q8NCU1 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC197Q8NCU1 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC197Q8NCU1 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC197Q8NCU1 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC197Q8NCU1 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC197Q8NCU1 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC197Q8NCU1 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC197Q8NCU1 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC197Q8NCU1 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC197Q8NCU1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms