Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBJ5

COLGALT1, Procollagen galactosyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLGALT1Q8NBJ5 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COLGALT1Q8NBJ5 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COLGALT1Q8NBJ5 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COLGALT1Q8NBJ5 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COLGALT1Q8NBJ5 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
COLGALT1Q8NBJ5 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COLGALT1Q8NBJ5 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COLGALT1Q8NBJ5 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COLGALT1Q8NBJ5 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COLGALT1Q8NBJ5 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COLGALT1Q8NBJ5 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COLGALT1Q8NBJ5 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COLGALT1Q8NBJ5 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
COLGALT1Q8NBJ5 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
COLGALT1Q8NBJ5 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
COLGALT1Q8NBJ5 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
COLGALT1Q8NBJ5 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COLGALT1Q8NBJ5 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COLGALT1Q8NBJ5 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COLGALT1Q8NBJ5 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COLGALT1Q8NBJ5 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COLGALT1Q8NBJ5 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
COLGALT1Q8NBJ5 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COLGALT1Q8NBJ5 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COLGALT1Q8NBJ5 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COLGALT1Q8NBJ5 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COLGALT1Q8NBJ5 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COLGALT1Q8NBJ5 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COLGALT1Q8NBJ5 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COLGALT1Q8NBJ5 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COLGALT1Q8NBJ5 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COLGALT1Q8NBJ5 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COLGALT1Q8NBJ5 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COLGALT1Q8NBJ5 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COLGALT1Q8NBJ5 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COLGALT1Q8NBJ5 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COLGALT1Q8NBJ5 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COLGALT1Q8NBJ5 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COLGALT1Q8NBJ5 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COLGALT1Q8NBJ5 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COLGALT1Q8NBJ5 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COLGALT1Q8NBJ5 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COLGALT1Q8NBJ5 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COLGALT1Q8NBJ5 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
COLGALT1Q8NBJ5 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COLGALT1Q8NBJ5 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COLGALT1Q8NBJ5 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COLGALT1Q8NBJ5 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
COLGALT1Q8NBJ5 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COLGALT1Q8NBJ5 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
COLGALT1Q8NBJ5 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COLGALT1Q8NBJ5 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COLGALT1Q8NBJ5 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COLGALT1Q8NBJ5 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COLGALT1Q8NBJ5 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COLGALT1Q8NBJ5 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COLGALT1Q8NBJ5 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COLGALT1Q8NBJ5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COLGALT1Q8NBJ5 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COLGALT1Q8NBJ5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COLGALT1Q8NBJ5 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COLGALT1Q8NBJ5 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COLGALT1Q8NBJ5 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COLGALT1Q8NBJ5 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COLGALT1Q8NBJ5 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COLGALT1Q8NBJ5 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COLGALT1Q8NBJ5 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COLGALT1Q8NBJ5 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COLGALT1Q8NBJ5 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COLGALT1Q8NBJ5 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COLGALT1Q8NBJ5 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COLGALT1Q8NBJ5 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COLGALT1Q8NBJ5 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COLGALT1Q8NBJ5 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COLGALT1Q8NBJ5 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COLGALT1Q8NBJ5 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COLGALT1Q8NBJ5 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COLGALT1Q8NBJ5 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COLGALT1Q8NBJ5 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COLGALT1Q8NBJ5 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COLGALT1Q8NBJ5 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COLGALT1Q8NBJ5 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COLGALT1Q8NBJ5 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COLGALT1Q8NBJ5 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COLGALT1Q8NBJ5 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
COLGALT1Q8NBJ5 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COLGALT1Q8NBJ5 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COLGALT1Q8NBJ5 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COLGALT1Q8NBJ5 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COLGALT1Q8NBJ5 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
COLGALT1Q8NBJ5 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
COLGALT1Q8NBJ5 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COLGALT1Q8NBJ5 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COLGALT1Q8NBJ5 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COLGALT1Q8NBJ5 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COLGALT1Q8NBJ5 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COLGALT1Q8NBJ5 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COLGALT1Q8NBJ5 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COLGALT1Q8NBJ5 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COLGALT1Q8NBJ5 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms