Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1G4

LRRC47, Leucine-rich repeat-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC47Q8N1G4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC47Q8N1G4 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC47Q8N1G4 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC47Q8N1G4 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC47Q8N1G4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC47Q8N1G4 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC47Q8N1G4 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC47Q8N1G4 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC47Q8N1G4 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC47Q8N1G4 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC47Q8N1G4 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC47Q8N1G4 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC47Q8N1G4 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC47Q8N1G4 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC47Q8N1G4 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC47Q8N1G4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC47Q8N1G4 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC47Q8N1G4 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC47Q8N1G4 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC47Q8N1G4 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC47Q8N1G4 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC47Q8N1G4 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC47Q8N1G4 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC47Q8N1G4 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC47Q8N1G4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC47Q8N1G4 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC47Q8N1G4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC47Q8N1G4 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC47Q8N1G4 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC47Q8N1G4 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC47Q8N1G4 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC47Q8N1G4 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC47Q8N1G4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC47Q8N1G4 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC47Q8N1G4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC47Q8N1G4 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC47Q8N1G4 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC47Q8N1G4 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC47Q8N1G4 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC47Q8N1G4 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC47Q8N1G4 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC47Q8N1G4 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC47Q8N1G4 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC47Q8N1G4 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC47Q8N1G4 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC47Q8N1G4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC47Q8N1G4 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC47Q8N1G4 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC47Q8N1G4 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC47Q8N1G4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC47Q8N1G4 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC47Q8N1G4 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC47Q8N1G4 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC47Q8N1G4 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC47Q8N1G4 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC47Q8N1G4 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC47Q8N1G4 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC47Q8N1G4 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC47Q8N1G4 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC47Q8N1G4 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC47Q8N1G4 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC47Q8N1G4 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC47Q8N1G4 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC47Q8N1G4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC47Q8N1G4 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC47Q8N1G4 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC47Q8N1G4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC47Q8N1G4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC47Q8N1G4 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC47Q8N1G4 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC47Q8N1G4 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC47Q8N1G4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC47Q8N1G4 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC47Q8N1G4 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC47Q8N1G4 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC47Q8N1G4 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC47Q8N1G4 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC47Q8N1G4 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC47Q8N1G4 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC47Q8N1G4 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC47Q8N1G4 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC47Q8N1G4 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC47Q8N1G4 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC47Q8N1G4 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC47Q8N1G4 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC47Q8N1G4 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC47Q8N1G4 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC47Q8N1G4 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC47Q8N1G4 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC47Q8N1G4 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC47Q8N1G4 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC47Q8N1G4 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC47Q8N1G4 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC47Q8N1G4 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC47Q8N1G4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC47Q8N1G4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC47Q8N1G4 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC47Q8N1G4 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC47Q8N1G4 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LRRC47Q8N1G4 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms