Protein–RNA interactions for Protein: Q8N158

GPC2, Glypican-2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC2Q8N158 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GPC2Q8N158 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GPC2Q8N158 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GPC2Q8N158 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GPC2Q8N158 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
GPC2Q8N158 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GPC2Q8N158 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GPC2Q8N158 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GPC2Q8N158 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GPC2Q8N158 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GPC2Q8N158 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GPC2Q8N158 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GPC2Q8N158 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GPC2Q8N158 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GPC2Q8N158 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GPC2Q8N158 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GPC2Q8N158 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GPC2Q8N158 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GPC2Q8N158 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GPC2Q8N158 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GPC2Q8N158 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GPC2Q8N158 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GPC2Q8N158 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GPC2Q8N158 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GPC2Q8N158 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GPC2Q8N158 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GPC2Q8N158 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GPC2Q8N158 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GPC2Q8N158 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
GPC2Q8N158 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GPC2Q8N158 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
GPC2Q8N158 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GPC2Q8N158 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GPC2Q8N158 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GPC2Q8N158 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GPC2Q8N158 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GPC2Q8N158 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GPC2Q8N158 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
GPC2Q8N158 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
GPC2Q8N158 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GPC2Q8N158 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GPC2Q8N158 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GPC2Q8N158 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GPC2Q8N158 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GPC2Q8N158 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GPC2Q8N158 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GPC2Q8N158 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GPC2Q8N158 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GPC2Q8N158 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GPC2Q8N158 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GPC2Q8N158 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GPC2Q8N158 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GPC2Q8N158 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GPC2Q8N158 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GPC2Q8N158 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GPC2Q8N158 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GPC2Q8N158 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GPC2Q8N158 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GPC2Q8N158 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GPC2Q8N158 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GPC2Q8N158 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GPC2Q8N158 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GPC2Q8N158 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GPC2Q8N158 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GPC2Q8N158 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GPC2Q8N158 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GPC2Q8N158 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
GPC2Q8N158 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GPC2Q8N158 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GPC2Q8N158 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GPC2Q8N158 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GPC2Q8N158 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GPC2Q8N158 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GPC2Q8N158 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GPC2Q8N158 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GPC2Q8N158 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
GPC2Q8N158 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GPC2Q8N158 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GPC2Q8N158 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GPC2Q8N158 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GPC2Q8N158 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
GPC2Q8N158 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GPC2Q8N158 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GPC2Q8N158 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GPC2Q8N158 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GPC2Q8N158 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GPC2Q8N158 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GPC2Q8N158 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GPC2Q8N158 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GPC2Q8N158 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GPC2Q8N158 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GPC2Q8N158 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GPC2Q8N158 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GPC2Q8N158 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GPC2Q8N158 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GPC2Q8N158 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GPC2Q8N158 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
GPC2Q8N158 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
GPC2Q8N158 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GPC2Q8N158 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms