Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYU2

HACE1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, humanhuman

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACE1Q8IYU2 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HACE1Q8IYU2 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HACE1Q8IYU2 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HACE1Q8IYU2 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HACE1Q8IYU2 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HACE1Q8IYU2 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HACE1Q8IYU2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HACE1Q8IYU2 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HACE1Q8IYU2 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HACE1Q8IYU2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HACE1Q8IYU2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HACE1Q8IYU2 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HACE1Q8IYU2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HACE1Q8IYU2 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HACE1Q8IYU2 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HACE1Q8IYU2 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HACE1Q8IYU2 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HACE1Q8IYU2 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
HACE1Q8IYU2 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
HACE1Q8IYU2 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HACE1Q8IYU2 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HACE1Q8IYU2 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HACE1Q8IYU2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
HACE1Q8IYU2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HACE1Q8IYU2 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
HACE1Q8IYU2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HACE1Q8IYU2 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HACE1Q8IYU2 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HACE1Q8IYU2 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HACE1Q8IYU2 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HACE1Q8IYU2 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HACE1Q8IYU2 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HACE1Q8IYU2 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HACE1Q8IYU2 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HACE1Q8IYU2 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HACE1Q8IYU2 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HACE1Q8IYU2 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HACE1Q8IYU2 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HACE1Q8IYU2 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HACE1Q8IYU2 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HACE1Q8IYU2 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HACE1Q8IYU2 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HACE1Q8IYU2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HACE1Q8IYU2 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HACE1Q8IYU2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HACE1Q8IYU2 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HACE1Q8IYU2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HACE1Q8IYU2 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HACE1Q8IYU2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HACE1Q8IYU2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HACE1Q8IYU2 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HACE1Q8IYU2 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HACE1Q8IYU2 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HACE1Q8IYU2 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HACE1Q8IYU2 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HACE1Q8IYU2 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HACE1Q8IYU2 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HACE1Q8IYU2 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HACE1Q8IYU2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HACE1Q8IYU2 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HACE1Q8IYU2 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HACE1Q8IYU2 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HACE1Q8IYU2 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HACE1Q8IYU2 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HACE1Q8IYU2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HACE1Q8IYU2 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HACE1Q8IYU2 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HACE1Q8IYU2 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HACE1Q8IYU2 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HACE1Q8IYU2 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HACE1Q8IYU2 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HACE1Q8IYU2 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HACE1Q8IYU2 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HACE1Q8IYU2 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HACE1Q8IYU2 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HACE1Q8IYU2 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HACE1Q8IYU2 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HACE1Q8IYU2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HACE1Q8IYU2 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HACE1Q8IYU2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HACE1Q8IYU2 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HACE1Q8IYU2 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HACE1Q8IYU2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HACE1Q8IYU2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HACE1Q8IYU2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HACE1Q8IYU2 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HACE1Q8IYU2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HACE1Q8IYU2 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HACE1Q8IYU2 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HACE1Q8IYU2 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HACE1Q8IYU2 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HACE1Q8IYU2 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HACE1Q8IYU2 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HACE1Q8IYU2 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HACE1Q8IYU2 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HACE1Q8IYU2 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HACE1Q8IYU2 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HACE1Q8IYU2 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HACE1Q8IYU2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HACE1Q8IYU2 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms