Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYM2

SLFN12, Schlafen family member 12, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN12Q8IYM2 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SLFN12Q8IYM2 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLFN12Q8IYM2 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SLFN12Q8IYM2 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLFN12Q8IYM2 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLFN12Q8IYM2 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLFN12Q8IYM2 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLFN12Q8IYM2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLFN12Q8IYM2 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLFN12Q8IYM2 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SLFN12Q8IYM2 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLFN12Q8IYM2 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLFN12Q8IYM2 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLFN12Q8IYM2 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLFN12Q8IYM2 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLFN12Q8IYM2 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLFN12Q8IYM2 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLFN12Q8IYM2 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLFN12Q8IYM2 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLFN12Q8IYM2 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLFN12Q8IYM2 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SLFN12Q8IYM2 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLFN12Q8IYM2 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLFN12Q8IYM2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLFN12Q8IYM2 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLFN12Q8IYM2 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLFN12Q8IYM2 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLFN12Q8IYM2 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLFN12Q8IYM2 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SLFN12Q8IYM2 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLFN12Q8IYM2 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLFN12Q8IYM2 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLFN12Q8IYM2 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLFN12Q8IYM2 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLFN12Q8IYM2 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLFN12Q8IYM2 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SLFN12Q8IYM2 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLFN12Q8IYM2 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SLFN12Q8IYM2 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLFN12Q8IYM2 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLFN12Q8IYM2 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLFN12Q8IYM2 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLFN12Q8IYM2 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLFN12Q8IYM2 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLFN12Q8IYM2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLFN12Q8IYM2 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLFN12Q8IYM2 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLFN12Q8IYM2 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLFN12Q8IYM2 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLFN12Q8IYM2 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SLFN12Q8IYM2 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLFN12Q8IYM2 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SLFN12Q8IYM2 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLFN12Q8IYM2 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLFN12Q8IYM2 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLFN12Q8IYM2 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLFN12Q8IYM2 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLFN12Q8IYM2 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SLFN12Q8IYM2 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLFN12Q8IYM2 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLFN12Q8IYM2 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLFN12Q8IYM2 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SLFN12Q8IYM2 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLFN12Q8IYM2 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLFN12Q8IYM2 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLFN12Q8IYM2 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLFN12Q8IYM2 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLFN12Q8IYM2 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLFN12Q8IYM2 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLFN12Q8IYM2 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLFN12Q8IYM2 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLFN12Q8IYM2 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLFN12Q8IYM2 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLFN12Q8IYM2 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLFN12Q8IYM2 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLFN12Q8IYM2 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLFN12Q8IYM2 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLFN12Q8IYM2 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLFN12Q8IYM2 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLFN12Q8IYM2 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLFN12Q8IYM2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLFN12Q8IYM2 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLFN12Q8IYM2 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLFN12Q8IYM2 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLFN12Q8IYM2 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLFN12Q8IYM2 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SLFN12Q8IYM2 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLFN12Q8IYM2 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLFN12Q8IYM2 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLFN12Q8IYM2 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLFN12Q8IYM2 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SLFN12Q8IYM2 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLFN12Q8IYM2 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLFN12Q8IYM2 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLFN12Q8IYM2 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SLFN12Q8IYM2 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLFN12Q8IYM2 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLFN12Q8IYM2 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLFN12Q8IYM2 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLFN12Q8IYM2 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms