Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
RPAP2Q8IXW5 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RPAP2Q8IXW5 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RPAP2Q8IXW5 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RPAP2Q8IXW5 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
RPAP2Q8IXW5 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RPAP2Q8IXW5 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RPAP2Q8IXW5 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RPAP2Q8IXW5 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RPAP2Q8IXW5 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RPAP2Q8IXW5 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RPAP2Q8IXW5 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RPAP2Q8IXW5 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RPAP2Q8IXW5 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RPAP2Q8IXW5 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RPAP2Q8IXW5 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RPAP2Q8IXW5 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RPAP2Q8IXW5 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
RPAP2Q8IXW5 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
RPAP2Q8IXW5 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RPAP2Q8IXW5 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RPAP2Q8IXW5 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RPAP2Q8IXW5 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RPAP2Q8IXW5 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RPAP2Q8IXW5 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RPAP2Q8IXW5 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
RPAP2Q8IXW5 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RPAP2Q8IXW5 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RPAP2Q8IXW5 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RPAP2Q8IXW5 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
RPAP2Q8IXW5 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
RPAP2Q8IXW5 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
RPAP2Q8IXW5 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RPAP2Q8IXW5 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RPAP2Q8IXW5 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RPAP2Q8IXW5 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RPAP2Q8IXW5 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
RPAP2Q8IXW5 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
RPAP2Q8IXW5 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RPAP2Q8IXW5 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RPAP2Q8IXW5 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RPAP2Q8IXW5 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RPAP2Q8IXW5 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RPAP2Q8IXW5 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RPAP2Q8IXW5 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RPAP2Q8IXW5 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPAP2Q8IXW5 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPAP2Q8IXW5 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPAP2Q8IXW5 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPAP2Q8IXW5 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPAP2Q8IXW5 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPAP2Q8IXW5 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPAP2Q8IXW5 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPAP2Q8IXW5 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPAP2Q8IXW5 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPAP2Q8IXW5 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPAP2Q8IXW5 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPAP2Q8IXW5 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPAP2Q8IXW5 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPAP2Q8IXW5 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPAP2Q8IXW5 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPAP2Q8IXW5 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPAP2Q8IXW5 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPAP2Q8IXW5 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPAP2Q8IXW5 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPAP2Q8IXW5 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPAP2Q8IXW5 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPAP2Q8IXW5 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPAP2Q8IXW5 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPAP2Q8IXW5 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPAP2Q8IXW5 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPAP2Q8IXW5 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPAP2Q8IXW5 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPAP2Q8IXW5 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPAP2Q8IXW5 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPAP2Q8IXW5 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPAP2Q8IXW5 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPAP2Q8IXW5 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPAP2Q8IXW5 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RPAP2Q8IXW5 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RPAP2Q8IXW5 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RPAP2Q8IXW5 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RPAP2Q8IXW5 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RPAP2Q8IXW5 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RPAP2Q8IXW5 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RPAP2Q8IXW5 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RPAP2Q8IXW5 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
RPAP2Q8IXW5 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RPAP2Q8IXW5 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
RPAP2Q8IXW5 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RPAP2Q8IXW5 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RPAP2Q8IXW5 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RPAP2Q8IXW5 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RPAP2Q8IXW5 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RPAP2Q8IXW5 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RPAP2Q8IXW5 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RPAP2Q8IXW5 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RPAP2Q8IXW5 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RPAP2Q8IXW5 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RPAP2Q8IXW5 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms