Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWQ3

BRSK2, Serine/threonine-protein kinase BRSK2, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRSK2Q8IWQ3 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRSK2Q8IWQ3 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRSK2Q8IWQ3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRSK2Q8IWQ3 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRSK2Q8IWQ3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRSK2Q8IWQ3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
BRSK2Q8IWQ3 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRSK2Q8IWQ3 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRSK2Q8IWQ3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRSK2Q8IWQ3 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRSK2Q8IWQ3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRSK2Q8IWQ3 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRSK2Q8IWQ3 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRSK2Q8IWQ3 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRSK2Q8IWQ3 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
BRSK2Q8IWQ3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRSK2Q8IWQ3 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRSK2Q8IWQ3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRSK2Q8IWQ3 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRSK2Q8IWQ3 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRSK2Q8IWQ3 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRSK2Q8IWQ3 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRSK2Q8IWQ3 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
BRSK2Q8IWQ3 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRSK2Q8IWQ3 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRSK2Q8IWQ3 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRSK2Q8IWQ3 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRSK2Q8IWQ3 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
BRSK2Q8IWQ3 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRSK2Q8IWQ3 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRSK2Q8IWQ3 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
BRSK2Q8IWQ3 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
BRSK2Q8IWQ3 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRSK2Q8IWQ3 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
BRSK2Q8IWQ3 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRSK2Q8IWQ3 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
BRSK2Q8IWQ3 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRSK2Q8IWQ3 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRSK2Q8IWQ3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRSK2Q8IWQ3 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRSK2Q8IWQ3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRSK2Q8IWQ3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRSK2Q8IWQ3 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRSK2Q8IWQ3 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRSK2Q8IWQ3 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
BRSK2Q8IWQ3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRSK2Q8IWQ3 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRSK2Q8IWQ3 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRSK2Q8IWQ3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRSK2Q8IWQ3 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRSK2Q8IWQ3 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRSK2Q8IWQ3 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRSK2Q8IWQ3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRSK2Q8IWQ3 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRSK2Q8IWQ3 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRSK2Q8IWQ3 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRSK2Q8IWQ3 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRSK2Q8IWQ3 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRSK2Q8IWQ3 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRSK2Q8IWQ3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRSK2Q8IWQ3 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRSK2Q8IWQ3 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRSK2Q8IWQ3 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRSK2Q8IWQ3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRSK2Q8IWQ3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
BRSK2Q8IWQ3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRSK2Q8IWQ3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRSK2Q8IWQ3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRSK2Q8IWQ3 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRSK2Q8IWQ3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRSK2Q8IWQ3 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRSK2Q8IWQ3 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRSK2Q8IWQ3 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRSK2Q8IWQ3 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRSK2Q8IWQ3 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRSK2Q8IWQ3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRSK2Q8IWQ3 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRSK2Q8IWQ3 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRSK2Q8IWQ3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRSK2Q8IWQ3 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRSK2Q8IWQ3 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
BRSK2Q8IWQ3 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRSK2Q8IWQ3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRSK2Q8IWQ3 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRSK2Q8IWQ3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRSK2Q8IWQ3 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRSK2Q8IWQ3 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRSK2Q8IWQ3 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRSK2Q8IWQ3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRSK2Q8IWQ3 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRSK2Q8IWQ3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRSK2Q8IWQ3 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRSK2Q8IWQ3 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRSK2Q8IWQ3 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRSK2Q8IWQ3 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRSK2Q8IWQ3 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRSK2Q8IWQ3 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
BRSK2Q8IWQ3 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
BRSK2Q8IWQ3 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
BRSK2Q8IWQ3 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms