Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVB4

SLC9A9, Sodium/hydrogen exchanger 9, humanhuman

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A9Q8IVB4 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC9A9Q8IVB4 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC9A9Q8IVB4 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC9A9Q8IVB4 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC9A9Q8IVB4 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC9A9Q8IVB4 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC9A9Q8IVB4 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC9A9Q8IVB4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC9A9Q8IVB4 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC9A9Q8IVB4 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC9A9Q8IVB4 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC9A9Q8IVB4 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC9A9Q8IVB4 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC9A9Q8IVB4 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC9A9Q8IVB4 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC9A9Q8IVB4 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC9A9Q8IVB4 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC9A9Q8IVB4 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC9A9Q8IVB4 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC9A9Q8IVB4 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC9A9Q8IVB4 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC9A9Q8IVB4 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC9A9Q8IVB4 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC9A9Q8IVB4 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC9A9Q8IVB4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC9A9Q8IVB4 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC9A9Q8IVB4 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC9A9Q8IVB4 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC9A9Q8IVB4 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC9A9Q8IVB4 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC9A9Q8IVB4 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC9A9Q8IVB4 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC9A9Q8IVB4 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC9A9Q8IVB4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC9A9Q8IVB4 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC9A9Q8IVB4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC9A9Q8IVB4 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC9A9Q8IVB4 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC9A9Q8IVB4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC9A9Q8IVB4 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC9A9Q8IVB4 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC9A9Q8IVB4 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC9A9Q8IVB4 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC9A9Q8IVB4 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC9A9Q8IVB4 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC9A9Q8IVB4 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC9A9Q8IVB4 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC9A9Q8IVB4 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC9A9Q8IVB4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC9A9Q8IVB4 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC9A9Q8IVB4 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC9A9Q8IVB4 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC9A9Q8IVB4 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC9A9Q8IVB4 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC9A9Q8IVB4 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC9A9Q8IVB4 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC9A9Q8IVB4 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC9A9Q8IVB4 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC9A9Q8IVB4 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC9A9Q8IVB4 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC9A9Q8IVB4 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC9A9Q8IVB4 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC9A9Q8IVB4 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC9A9Q8IVB4 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC9A9Q8IVB4 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC9A9Q8IVB4 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC9A9Q8IVB4 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC9A9Q8IVB4 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC9A9Q8IVB4 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC9A9Q8IVB4 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC9A9Q8IVB4 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC9A9Q8IVB4 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC9A9Q8IVB4 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC9A9Q8IVB4 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC9A9Q8IVB4 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC9A9Q8IVB4 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC9A9Q8IVB4 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC9A9Q8IVB4 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC9A9Q8IVB4 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC9A9Q8IVB4 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC9A9Q8IVB4 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC9A9Q8IVB4 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC9A9Q8IVB4 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC9A9Q8IVB4 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC9A9Q8IVB4 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC9A9Q8IVB4 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC9A9Q8IVB4 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC9A9Q8IVB4 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC9A9Q8IVB4 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC9A9Q8IVB4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC9A9Q8IVB4 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC9A9Q8IVB4 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC9A9Q8IVB4 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC9A9Q8IVB4 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC9A9Q8IVB4 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC9A9Q8IVB4 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC9A9Q8IVB4 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC9A9Q8IVB4 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC9A9Q8IVB4 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC9A9Q8IVB4 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms