Protein–RNA interactions for Protein: Q86VQ6

TXNRD3, Thioredoxin reductase 3, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNRD3Q86VQ6 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TXNRD3Q86VQ6 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TXNRD3Q86VQ6 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TXNRD3Q86VQ6 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TXNRD3Q86VQ6 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TXNRD3Q86VQ6 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TXNRD3Q86VQ6 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TXNRD3Q86VQ6 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TXNRD3Q86VQ6 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TXNRD3Q86VQ6 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TXNRD3Q86VQ6 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TXNRD3Q86VQ6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TXNRD3Q86VQ6 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TXNRD3Q86VQ6 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TXNRD3Q86VQ6 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TXNRD3Q86VQ6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TXNRD3Q86VQ6 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TXNRD3Q86VQ6 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TXNRD3Q86VQ6 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TXNRD3Q86VQ6 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TXNRD3Q86VQ6 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TXNRD3Q86VQ6 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TXNRD3Q86VQ6 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TXNRD3Q86VQ6 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TXNRD3Q86VQ6 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TXNRD3Q86VQ6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TXNRD3Q86VQ6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TXNRD3Q86VQ6 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TXNRD3Q86VQ6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TXNRD3Q86VQ6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TXNRD3Q86VQ6 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TXNRD3Q86VQ6 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TXNRD3Q86VQ6 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TXNRD3Q86VQ6 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TXNRD3Q86VQ6 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TXNRD3Q86VQ6 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TXNRD3Q86VQ6 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TXNRD3Q86VQ6 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TXNRD3Q86VQ6 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TXNRD3Q86VQ6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TXNRD3Q86VQ6 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TXNRD3Q86VQ6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TXNRD3Q86VQ6 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TXNRD3Q86VQ6 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TXNRD3Q86VQ6 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TXNRD3Q86VQ6 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TXNRD3Q86VQ6 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TXNRD3Q86VQ6 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TXNRD3Q86VQ6 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TXNRD3Q86VQ6 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TXNRD3Q86VQ6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TXNRD3Q86VQ6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TXNRD3Q86VQ6 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TXNRD3Q86VQ6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TXNRD3Q86VQ6 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TXNRD3Q86VQ6 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TXNRD3Q86VQ6 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TXNRD3Q86VQ6 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TXNRD3Q86VQ6 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TXNRD3Q86VQ6 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TXNRD3Q86VQ6 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TXNRD3Q86VQ6 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TXNRD3Q86VQ6 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TXNRD3Q86VQ6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TXNRD3Q86VQ6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TXNRD3Q86VQ6 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TXNRD3Q86VQ6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TXNRD3Q86VQ6 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TXNRD3Q86VQ6 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TXNRD3Q86VQ6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TXNRD3Q86VQ6 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TXNRD3Q86VQ6 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TXNRD3Q86VQ6 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TXNRD3Q86VQ6 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TXNRD3Q86VQ6 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TXNRD3Q86VQ6 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TXNRD3Q86VQ6 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TXNRD3Q86VQ6 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TXNRD3Q86VQ6 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TXNRD3Q86VQ6 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TXNRD3Q86VQ6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TXNRD3Q86VQ6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TXNRD3Q86VQ6 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TXNRD3Q86VQ6 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TXNRD3Q86VQ6 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TXNRD3Q86VQ6 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TXNRD3Q86VQ6 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TXNRD3Q86VQ6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TXNRD3Q86VQ6 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TXNRD3Q86VQ6 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TXNRD3Q86VQ6 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TXNRD3Q86VQ6 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TXNRD3Q86VQ6 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TXNRD3Q86VQ6 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TXNRD3Q86VQ6 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TXNRD3Q86VQ6 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TXNRD3Q86VQ6 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TXNRD3Q86VQ6 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TXNRD3Q86VQ6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TXNRD3Q86VQ6 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms