Protein–RNA interactions for Protein: Q86V81

ALYREF, THO complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREFQ86V81 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALYREFQ86V81 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALYREFQ86V81 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALYREFQ86V81 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALYREFQ86V81 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ALYREFQ86V81 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALYREFQ86V81 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALYREFQ86V81 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALYREFQ86V81 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALYREFQ86V81 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALYREFQ86V81 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALYREFQ86V81 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALYREFQ86V81 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALYREFQ86V81 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ALYREFQ86V81 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALYREFQ86V81 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALYREFQ86V81 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALYREFQ86V81 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALYREFQ86V81 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALYREFQ86V81 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALYREFQ86V81 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ALYREFQ86V81 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ALYREFQ86V81 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ALYREFQ86V81 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ALYREFQ86V81 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ALYREFQ86V81 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ALYREFQ86V81 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ALYREFQ86V81 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ALYREFQ86V81 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ALYREFQ86V81 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ALYREFQ86V81 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ALYREFQ86V81 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ALYREFQ86V81 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ALYREFQ86V81 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ALYREFQ86V81 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ALYREFQ86V81 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ALYREFQ86V81 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ALYREFQ86V81 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ALYREFQ86V81 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ALYREFQ86V81 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ALYREFQ86V81 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ALYREFQ86V81 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ALYREFQ86V81 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ALYREFQ86V81 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ALYREFQ86V81 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ALYREFQ86V81 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ALYREFQ86V81 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ALYREFQ86V81 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ALYREFQ86V81 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ALYREFQ86V81 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ALYREFQ86V81 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ALYREFQ86V81 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ALYREFQ86V81 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ALYREFQ86V81 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ALYREFQ86V81 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ALYREFQ86V81 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ALYREFQ86V81 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ALYREFQ86V81 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ALYREFQ86V81 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ALYREFQ86V81 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ALYREFQ86V81 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ALYREFQ86V81 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ALYREFQ86V81 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ALYREFQ86V81 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ALYREFQ86V81 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ALYREFQ86V81 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ALYREFQ86V81 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ALYREFQ86V81 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ALYREFQ86V81 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ALYREFQ86V81 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ALYREFQ86V81 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ALYREFQ86V81 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ALYREFQ86V81 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ALYREFQ86V81 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ALYREFQ86V81 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ALYREFQ86V81 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ALYREFQ86V81 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ALYREFQ86V81 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ALYREFQ86V81 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ALYREFQ86V81 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ALYREFQ86V81 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ALYREFQ86V81 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ALYREFQ86V81 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ALYREFQ86V81 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ALYREFQ86V81 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ALYREFQ86V81 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ALYREFQ86V81 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ALYREFQ86V81 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ALYREFQ86V81 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ALYREFQ86V81 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ALYREFQ86V81 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ALYREFQ86V81 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ALYREFQ86V81 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ALYREFQ86V81 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ALYREFQ86V81 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ALYREFQ86V81 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ALYREFQ86V81 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ALYREFQ86V81 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ALYREFQ86V81 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ALYREFQ86V81 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
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