Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC84Q86UT8 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC84Q86UT8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC84Q86UT8 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC84Q86UT8 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC84Q86UT8 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC84Q86UT8 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC84Q86UT8 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC84Q86UT8 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC84Q86UT8 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC84Q86UT8 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC84Q86UT8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC84Q86UT8 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC84Q86UT8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC84Q86UT8 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC84Q86UT8 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC84Q86UT8 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC84Q86UT8 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC84Q86UT8 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC84Q86UT8 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC84Q86UT8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC84Q86UT8 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC84Q86UT8 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC84Q86UT8 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC84Q86UT8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC84Q86UT8 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC84Q86UT8 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC84Q86UT8 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC84Q86UT8 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC84Q86UT8 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC84Q86UT8 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC84Q86UT8 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC84Q86UT8 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC84Q86UT8 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC84Q86UT8 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC84Q86UT8 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC84Q86UT8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC84Q86UT8 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC84Q86UT8 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC84Q86UT8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC84Q86UT8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC84Q86UT8 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC84Q86UT8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC84Q86UT8 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC84Q86UT8 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC84Q86UT8 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC84Q86UT8 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC84Q86UT8 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC84Q86UT8 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC84Q86UT8 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC84Q86UT8 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC84Q86UT8 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC84Q86UT8 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC84Q86UT8 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC84Q86UT8 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC84Q86UT8 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC84Q86UT8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC84Q86UT8 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC84Q86UT8 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC84Q86UT8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC84Q86UT8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC84Q86UT8 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC84Q86UT8 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC84Q86UT8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC84Q86UT8 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC84Q86UT8 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC84Q86UT8 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC84Q86UT8 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC84Q86UT8 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC84Q86UT8 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC84Q86UT8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC84Q86UT8 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC84Q86UT8 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC84Q86UT8 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC84Q86UT8 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC84Q86UT8 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC84Q86UT8 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC84Q86UT8 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC84Q86UT8 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC84Q86UT8 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC84Q86UT8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC84Q86UT8 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC84Q86UT8 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC84Q86UT8 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC84Q86UT8 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC84Q86UT8 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC84Q86UT8 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC84Q86UT8 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC84Q86UT8 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC84Q86UT8 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC84Q86UT8 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC84Q86UT8 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC84Q86UT8 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC84Q86UT8 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC84Q86UT8 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC84Q86UT8 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC84Q86UT8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC84Q86UT8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC84Q86UT8 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC84Q86UT8 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms