Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3C6

ATG9A, Autophagy-related protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9AQ7Z3C6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ATG9AQ7Z3C6 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATG9AQ7Z3C6 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATG9AQ7Z3C6 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATG9AQ7Z3C6 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ATG9AQ7Z3C6 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ATG9AQ7Z3C6 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATG9AQ7Z3C6 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATG9AQ7Z3C6 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATG9AQ7Z3C6 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATG9AQ7Z3C6 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATG9AQ7Z3C6 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATG9AQ7Z3C6 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATG9AQ7Z3C6 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATG9AQ7Z3C6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATG9AQ7Z3C6 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATG9AQ7Z3C6 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATG9AQ7Z3C6 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATG9AQ7Z3C6 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATG9AQ7Z3C6 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATG9AQ7Z3C6 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
ATG9AQ7Z3C6 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATG9AQ7Z3C6 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATG9AQ7Z3C6 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATG9AQ7Z3C6 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATG9AQ7Z3C6 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATG9AQ7Z3C6 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATG9AQ7Z3C6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATG9AQ7Z3C6 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ATG9AQ7Z3C6 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ATG9AQ7Z3C6 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
ATG9AQ7Z3C6 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
ATG9AQ7Z3C6 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATG9AQ7Z3C6 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATG9AQ7Z3C6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATG9AQ7Z3C6 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATG9AQ7Z3C6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATG9AQ7Z3C6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATG9AQ7Z3C6 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATG9AQ7Z3C6 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATG9AQ7Z3C6 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATG9AQ7Z3C6 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATG9AQ7Z3C6 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATG9AQ7Z3C6 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATG9AQ7Z3C6 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATG9AQ7Z3C6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATG9AQ7Z3C6 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATG9AQ7Z3C6 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATG9AQ7Z3C6 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATG9AQ7Z3C6 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATG9AQ7Z3C6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATG9AQ7Z3C6 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ATG9AQ7Z3C6 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATG9AQ7Z3C6 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ATG9AQ7Z3C6 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATG9AQ7Z3C6 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATG9AQ7Z3C6 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATG9AQ7Z3C6 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATG9AQ7Z3C6 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATG9AQ7Z3C6 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATG9AQ7Z3C6 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATG9AQ7Z3C6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATG9AQ7Z3C6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATG9AQ7Z3C6 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATG9AQ7Z3C6 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATG9AQ7Z3C6 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
ATG9AQ7Z3C6 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATG9AQ7Z3C6 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATG9AQ7Z3C6 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
ATG9AQ7Z3C6 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATG9AQ7Z3C6 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATG9AQ7Z3C6 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATG9AQ7Z3C6 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATG9AQ7Z3C6 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATG9AQ7Z3C6 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATG9AQ7Z3C6 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATG9AQ7Z3C6 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATG9AQ7Z3C6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATG9AQ7Z3C6 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATG9AQ7Z3C6 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATG9AQ7Z3C6 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATG9AQ7Z3C6 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATG9AQ7Z3C6 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATG9AQ7Z3C6 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATG9AQ7Z3C6 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATG9AQ7Z3C6 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATG9AQ7Z3C6 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ATG9AQ7Z3C6 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ATG9AQ7Z3C6 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATG9AQ7Z3C6 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ATG9AQ7Z3C6 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATG9AQ7Z3C6 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATG9AQ7Z3C6 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATG9AQ7Z3C6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATG9AQ7Z3C6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATG9AQ7Z3C6 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATG9AQ7Z3C6 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATG9AQ7Z3C6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ATG9AQ7Z3C6 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATG9AQ7Z3C6 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms