Protein–RNA interactions for Protein: Q7L1I2

SV2B, Synaptic vesicle glycoprotein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2BQ7L1I2 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SV2BQ7L1I2 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SV2BQ7L1I2 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SV2BQ7L1I2 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SV2BQ7L1I2 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SV2BQ7L1I2 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SV2BQ7L1I2 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SV2BQ7L1I2 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SV2BQ7L1I2 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SV2BQ7L1I2 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SV2BQ7L1I2 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SV2BQ7L1I2 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SV2BQ7L1I2 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SV2BQ7L1I2 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SV2BQ7L1I2 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SV2BQ7L1I2 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SV2BQ7L1I2 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SV2BQ7L1I2 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SV2BQ7L1I2 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SV2BQ7L1I2 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SV2BQ7L1I2 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SV2BQ7L1I2 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SV2BQ7L1I2 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SV2BQ7L1I2 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SV2BQ7L1I2 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SV2BQ7L1I2 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SV2BQ7L1I2 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SV2BQ7L1I2 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SV2BQ7L1I2 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SV2BQ7L1I2 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SV2BQ7L1I2 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SV2BQ7L1I2 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SV2BQ7L1I2 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SV2BQ7L1I2 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SV2BQ7L1I2 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SV2BQ7L1I2 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SV2BQ7L1I2 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SV2BQ7L1I2 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SV2BQ7L1I2 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SV2BQ7L1I2 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SV2BQ7L1I2 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SV2BQ7L1I2 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SV2BQ7L1I2 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SV2BQ7L1I2 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SV2BQ7L1I2 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SV2BQ7L1I2 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SV2BQ7L1I2 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SV2BQ7L1I2 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SV2BQ7L1I2 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SV2BQ7L1I2 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SV2BQ7L1I2 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SV2BQ7L1I2 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SV2BQ7L1I2 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SV2BQ7L1I2 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SV2BQ7L1I2 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SV2BQ7L1I2 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SV2BQ7L1I2 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SV2BQ7L1I2 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SV2BQ7L1I2 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SV2BQ7L1I2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SV2BQ7L1I2 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SV2BQ7L1I2 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SV2BQ7L1I2 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SV2BQ7L1I2 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SV2BQ7L1I2 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SV2BQ7L1I2 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SV2BQ7L1I2 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SV2BQ7L1I2 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SV2BQ7L1I2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SV2BQ7L1I2 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SV2BQ7L1I2 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SV2BQ7L1I2 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SV2BQ7L1I2 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SV2BQ7L1I2 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SV2BQ7L1I2 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SV2BQ7L1I2 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SV2BQ7L1I2 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SV2BQ7L1I2 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SV2BQ7L1I2 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SV2BQ7L1I2 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SV2BQ7L1I2 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SV2BQ7L1I2 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SV2BQ7L1I2 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SV2BQ7L1I2 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SV2BQ7L1I2 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SV2BQ7L1I2 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SV2BQ7L1I2 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SV2BQ7L1I2 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SV2BQ7L1I2 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SV2BQ7L1I2 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SV2BQ7L1I2 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SV2BQ7L1I2 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SV2BQ7L1I2 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SV2BQ7L1I2 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SV2BQ7L1I2 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SV2BQ7L1I2 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SV2BQ7L1I2 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SV2BQ7L1I2 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SV2BQ7L1I2 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SV2BQ7L1I2 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.1 ms