Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC1

PP13850, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q71RC1 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q71RC1 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q71RC1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q71RC1 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q71RC1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q71RC1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q71RC1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q71RC1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q71RC1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q71RC1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q71RC1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q71RC1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q71RC1 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q71RC1 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q71RC1 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q71RC1 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q71RC1 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q71RC1 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q71RC1 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q71RC1 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q71RC1 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Q71RC1 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q71RC1 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q71RC1 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Q71RC1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q71RC1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q71RC1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q71RC1 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q71RC1 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Q71RC1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q71RC1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q71RC1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q71RC1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q71RC1 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q71RC1 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q71RC1 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q71RC1 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q71RC1 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q71RC1 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q71RC1 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Q71RC1 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q71RC1 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Q71RC1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q71RC1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q71RC1 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q71RC1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q71RC1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q71RC1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q71RC1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q71RC1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q71RC1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q71RC1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q71RC1 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q71RC1 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q71RC1 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q71RC1 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q71RC1 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q71RC1 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q71RC1 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q71RC1 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q71RC1 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q71RC1 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q71RC1 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q71RC1 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q71RC1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q71RC1 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q71RC1 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Q71RC1 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q71RC1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q71RC1 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Q71RC1 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q71RC1 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q71RC1 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q71RC1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q71RC1 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q71RC1 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q71RC1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q71RC1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q71RC1 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Q71RC1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q71RC1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q71RC1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q71RC1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q71RC1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q71RC1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q71RC1 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q71RC1 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Q71RC1 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Q71RC1 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q71RC1 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q71RC1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q71RC1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q71RC1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q71RC1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q71RC1 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q71RC1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Q71RC1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q71RC1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q71RC1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q71RC1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms