Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

Predictions only

Length 1,123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP43Q70EL4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP43Q70EL4 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP43Q70EL4 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP43Q70EL4 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP43Q70EL4 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP43Q70EL4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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USP43Q70EL4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP43Q70EL4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
USP43Q70EL4 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP43Q70EL4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
USP43Q70EL4 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP43Q70EL4 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP43Q70EL4 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP43Q70EL4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
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USP43Q70EL4 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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USP43Q70EL4 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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USP43Q70EL4 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
USP43Q70EL4 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
USP43Q70EL4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
USP43Q70EL4 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
USP43Q70EL4 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
USP43Q70EL4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
USP43Q70EL4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
USP43Q70EL4 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
USP43Q70EL4 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
USP43Q70EL4 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
USP43Q70EL4 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
USP43Q70EL4 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
USP43Q70EL4 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
USP43Q70EL4 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
USP43Q70EL4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
USP43Q70EL4 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
USP43Q70EL4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
USP43Q70EL4 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
USP43Q70EL4 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
USP43Q70EL4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
USP43Q70EL4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
USP43Q70EL4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
USP43Q70EL4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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USP43Q70EL4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
USP43Q70EL4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
USP43Q70EL4 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
USP43Q70EL4 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
USP43Q70EL4 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
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USP43Q70EL4 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
USP43Q70EL4 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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USP43Q70EL4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
USP43Q70EL4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
USP43Q70EL4 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
USP43Q70EL4 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
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USP43Q70EL4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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USP43Q70EL4 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
USP43Q70EL4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
USP43Q70EL4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
USP43Q70EL4 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
USP43Q70EL4 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
USP43Q70EL4 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
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USP43Q70EL4 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
USP43Q70EL4 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
USP43Q70EL4 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
USP43Q70EL4 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
USP43Q70EL4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
USP43Q70EL4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
USP43Q70EL4 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
USP43Q70EL4 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
USP43Q70EL4 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
USP43Q70EL4 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
USP43Q70EL4 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
USP43Q70EL4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
USP43Q70EL4 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
USP43Q70EL4 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
USP43Q70EL4 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
USP43Q70EL4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
USP43Q70EL4 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
USP43Q70EL4 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
USP43Q70EL4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
USP43Q70EL4 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
USP43Q70EL4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
USP43Q70EL4 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
USP43Q70EL4 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
USP43Q70EL4 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
USP43Q70EL4 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
USP43Q70EL4 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
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