Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW31

SYDE1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1Q6ZW31 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYDE1Q6ZW31 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYDE1Q6ZW31 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYDE1Q6ZW31 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SYDE1Q6ZW31 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYDE1Q6ZW31 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYDE1Q6ZW31 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYDE1Q6ZW31 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SYDE1Q6ZW31 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYDE1Q6ZW31 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYDE1Q6ZW31 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYDE1Q6ZW31 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYDE1Q6ZW31 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYDE1Q6ZW31 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYDE1Q6ZW31 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYDE1Q6ZW31 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYDE1Q6ZW31 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYDE1Q6ZW31 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYDE1Q6ZW31 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYDE1Q6ZW31 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYDE1Q6ZW31 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYDE1Q6ZW31 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYDE1Q6ZW31 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYDE1Q6ZW31 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SYDE1Q6ZW31 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYDE1Q6ZW31 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYDE1Q6ZW31 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYDE1Q6ZW31 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYDE1Q6ZW31 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYDE1Q6ZW31 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYDE1Q6ZW31 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYDE1Q6ZW31 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYDE1Q6ZW31 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYDE1Q6ZW31 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYDE1Q6ZW31 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYDE1Q6ZW31 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYDE1Q6ZW31 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYDE1Q6ZW31 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYDE1Q6ZW31 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYDE1Q6ZW31 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYDE1Q6ZW31 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SYDE1Q6ZW31 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYDE1Q6ZW31 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYDE1Q6ZW31 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYDE1Q6ZW31 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYDE1Q6ZW31 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYDE1Q6ZW31 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYDE1Q6ZW31 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYDE1Q6ZW31 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYDE1Q6ZW31 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYDE1Q6ZW31 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SYDE1Q6ZW31 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYDE1Q6ZW31 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYDE1Q6ZW31 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYDE1Q6ZW31 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYDE1Q6ZW31 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYDE1Q6ZW31 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SYDE1Q6ZW31 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYDE1Q6ZW31 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYDE1Q6ZW31 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYDE1Q6ZW31 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYDE1Q6ZW31 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYDE1Q6ZW31 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYDE1Q6ZW31 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYDE1Q6ZW31 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYDE1Q6ZW31 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYDE1Q6ZW31 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYDE1Q6ZW31 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYDE1Q6ZW31 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYDE1Q6ZW31 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYDE1Q6ZW31 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYDE1Q6ZW31 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYDE1Q6ZW31 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYDE1Q6ZW31 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYDE1Q6ZW31 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SYDE1Q6ZW31 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SYDE1Q6ZW31 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SYDE1Q6ZW31 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
SYDE1Q6ZW31 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYDE1Q6ZW31 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYDE1Q6ZW31 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYDE1Q6ZW31 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYDE1Q6ZW31 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYDE1Q6ZW31 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SYDE1Q6ZW31 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYDE1Q6ZW31 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SYDE1Q6ZW31 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SYDE1Q6ZW31 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SYDE1Q6ZW31 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SYDE1Q6ZW31 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYDE1Q6ZW31 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SYDE1Q6ZW31 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SYDE1Q6ZW31 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SYDE1Q6ZW31 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SYDE1Q6ZW31 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYDE1Q6ZW31 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SYDE1Q6ZW31 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYDE1Q6ZW31 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SYDE1Q6ZW31 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SYDE1Q6ZW31 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms