Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

Predictions only

Length 1,888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
UBR3Q6ZT12 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
UBR3Q6ZT12 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
UBR3Q6ZT12 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
UBR3Q6ZT12 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
UBR3Q6ZT12 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
UBR3Q6ZT12 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
UBR3Q6ZT12 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
UBR3Q6ZT12 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
UBR3Q6ZT12 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
UBR3Q6ZT12 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
UBR3Q6ZT12 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
UBR3Q6ZT12 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
UBR3Q6ZT12 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
UBR3Q6ZT12 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
UBR3Q6ZT12 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
UBR3Q6ZT12 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
UBR3Q6ZT12 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
UBR3Q6ZT12 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
UBR3Q6ZT12 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
UBR3Q6ZT12 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
UBR3Q6ZT12 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
UBR3Q6ZT12 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
UBR3Q6ZT12 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
UBR3Q6ZT12 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
UBR3Q6ZT12 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
UBR3Q6ZT12 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
UBR3Q6ZT12 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
UBR3Q6ZT12 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
UBR3Q6ZT12 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
UBR3Q6ZT12 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
UBR3Q6ZT12 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
UBR3Q6ZT12 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
UBR3Q6ZT12 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
UBR3Q6ZT12 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
UBR3Q6ZT12 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
UBR3Q6ZT12 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
UBR3Q6ZT12 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
UBR3Q6ZT12 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
UBR3Q6ZT12 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
UBR3Q6ZT12 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
UBR3Q6ZT12 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
UBR3Q6ZT12 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
UBR3Q6ZT12 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
UBR3Q6ZT12 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
UBR3Q6ZT12 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
UBR3Q6ZT12 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
UBR3Q6ZT12 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
UBR3Q6ZT12 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
UBR3Q6ZT12 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
UBR3Q6ZT12 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
UBR3Q6ZT12 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
UBR3Q6ZT12 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
UBR3Q6ZT12 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
UBR3Q6ZT12 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
UBR3Q6ZT12 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
UBR3Q6ZT12 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
UBR3Q6ZT12 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
UBR3Q6ZT12 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
UBR3Q6ZT12 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
UBR3Q6ZT12 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
UBR3Q6ZT12 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
UBR3Q6ZT12 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
UBR3Q6ZT12 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
UBR3Q6ZT12 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
UBR3Q6ZT12 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
UBR3Q6ZT12 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
UBR3Q6ZT12 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
UBR3Q6ZT12 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
UBR3Q6ZT12 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
UBR3Q6ZT12 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
UBR3Q6ZT12 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
UBR3Q6ZT12 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
UBR3Q6ZT12 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
UBR3Q6ZT12 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
UBR3Q6ZT12 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
UBR3Q6ZT12 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
UBR3Q6ZT12 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
UBR3Q6ZT12 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
UBR3Q6ZT12 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
UBR3Q6ZT12 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
UBR3Q6ZT12 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
UBR3Q6ZT12 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
UBR3Q6ZT12 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
UBR3Q6ZT12 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
UBR3Q6ZT12 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
UBR3Q6ZT12 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
UBR3Q6ZT12 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
UBR3Q6ZT12 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
UBR3Q6ZT12 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
UBR3Q6ZT12 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
UBR3Q6ZT12 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
UBR3Q6ZT12 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
UBR3Q6ZT12 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
UBR3Q6ZT12 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
UBR3Q6ZT12 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
UBR3Q6ZT12 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
UBR3Q6ZT12 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
UBR3Q6ZT12 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
UBR3Q6ZT12 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms