Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQX7

LIAT1, Protein LIAT1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIAT1Q6ZQX7 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms