Protein–RNA interactions for Protein: Q6UN15

FIP1L1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FIP1L1Q6UN15 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FIP1L1Q6UN15 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FIP1L1Q6UN15 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FIP1L1Q6UN15 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FIP1L1Q6UN15 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FIP1L1Q6UN15 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
FIP1L1Q6UN15 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
FIP1L1Q6UN15 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
FIP1L1Q6UN15 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FIP1L1Q6UN15 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FIP1L1Q6UN15 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
FIP1L1Q6UN15 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FIP1L1Q6UN15 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FIP1L1Q6UN15 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FIP1L1Q6UN15 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FIP1L1Q6UN15 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FIP1L1Q6UN15 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
FIP1L1Q6UN15 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FIP1L1Q6UN15 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
FIP1L1Q6UN15 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FIP1L1Q6UN15 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FIP1L1Q6UN15 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FIP1L1Q6UN15 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FIP1L1Q6UN15 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FIP1L1Q6UN15 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FIP1L1Q6UN15 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FIP1L1Q6UN15 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FIP1L1Q6UN15 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FIP1L1Q6UN15 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FIP1L1Q6UN15 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FIP1L1Q6UN15 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FIP1L1Q6UN15 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FIP1L1Q6UN15 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FIP1L1Q6UN15 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FIP1L1Q6UN15 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FIP1L1Q6UN15 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FIP1L1Q6UN15 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FIP1L1Q6UN15 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FIP1L1Q6UN15 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FIP1L1Q6UN15 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FIP1L1Q6UN15 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FIP1L1Q6UN15 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FIP1L1Q6UN15 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FIP1L1Q6UN15 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FIP1L1Q6UN15 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FIP1L1Q6UN15 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FIP1L1Q6UN15 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FIP1L1Q6UN15 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FIP1L1Q6UN15 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FIP1L1Q6UN15 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FIP1L1Q6UN15 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FIP1L1Q6UN15 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FIP1L1Q6UN15 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FIP1L1Q6UN15 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FIP1L1Q6UN15 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
FIP1L1Q6UN15 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FIP1L1Q6UN15 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FIP1L1Q6UN15 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FIP1L1Q6UN15 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FIP1L1Q6UN15 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FIP1L1Q6UN15 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FIP1L1Q6UN15 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FIP1L1Q6UN15 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FIP1L1Q6UN15 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FIP1L1Q6UN15 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FIP1L1Q6UN15 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FIP1L1Q6UN15 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FIP1L1Q6UN15 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FIP1L1Q6UN15 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FIP1L1Q6UN15 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FIP1L1Q6UN15 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FIP1L1Q6UN15 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FIP1L1Q6UN15 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FIP1L1Q6UN15 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FIP1L1Q6UN15 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FIP1L1Q6UN15 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FIP1L1Q6UN15 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FIP1L1Q6UN15 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FIP1L1Q6UN15 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FIP1L1Q6UN15 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FIP1L1Q6UN15 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FIP1L1Q6UN15 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FIP1L1Q6UN15 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FIP1L1Q6UN15 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FIP1L1Q6UN15 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FIP1L1Q6UN15 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FIP1L1Q6UN15 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FIP1L1Q6UN15 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FIP1L1Q6UN15 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
FIP1L1Q6UN15 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FIP1L1Q6UN15 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FIP1L1Q6UN15 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FIP1L1Q6UN15 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FIP1L1Q6UN15 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FIP1L1Q6UN15 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FIP1L1Q6UN15 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FIP1L1Q6UN15 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FIP1L1Q6UN15 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
FIP1L1Q6UN15 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FIP1L1Q6UN15 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms