Protein–RNA interactions for Protein: Q6TFL3

CCDC171, Coiled-coil domain-containing protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 1,326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171Q6TFL3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC171Q6TFL3 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC171Q6TFL3 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC171Q6TFL3 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC171Q6TFL3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC171Q6TFL3 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC171Q6TFL3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC171Q6TFL3 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC171Q6TFL3 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC171Q6TFL3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC171Q6TFL3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC171Q6TFL3 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC171Q6TFL3 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC171Q6TFL3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CCDC171Q6TFL3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CCDC171Q6TFL3 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC171Q6TFL3 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC171Q6TFL3 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC171Q6TFL3 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC171Q6TFL3 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC171Q6TFL3 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC171Q6TFL3 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC171Q6TFL3 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC171Q6TFL3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC171Q6TFL3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC171Q6TFL3 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC171Q6TFL3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC171Q6TFL3 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC171Q6TFL3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC171Q6TFL3 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC171Q6TFL3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC171Q6TFL3 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC171Q6TFL3 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC171Q6TFL3 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC171Q6TFL3 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC171Q6TFL3 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC171Q6TFL3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC171Q6TFL3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC171Q6TFL3 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC171Q6TFL3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC171Q6TFL3 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC171Q6TFL3 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC171Q6TFL3 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC171Q6TFL3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC171Q6TFL3 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC171Q6TFL3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC171Q6TFL3 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC171Q6TFL3 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC171Q6TFL3 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC171Q6TFL3 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC171Q6TFL3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC171Q6TFL3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC171Q6TFL3 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC171Q6TFL3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC171Q6TFL3 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC171Q6TFL3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC171Q6TFL3 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC171Q6TFL3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC171Q6TFL3 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC171Q6TFL3 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC171Q6TFL3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC171Q6TFL3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC171Q6TFL3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC171Q6TFL3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC171Q6TFL3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC171Q6TFL3 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC171Q6TFL3 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC171Q6TFL3 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC171Q6TFL3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC171Q6TFL3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC171Q6TFL3 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC171Q6TFL3 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC171Q6TFL3 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC171Q6TFL3 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC171Q6TFL3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC171Q6TFL3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC171Q6TFL3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC171Q6TFL3 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC171Q6TFL3 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC171Q6TFL3 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC171Q6TFL3 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC171Q6TFL3 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC171Q6TFL3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC171Q6TFL3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC171Q6TFL3 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC171Q6TFL3 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC171Q6TFL3 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC171Q6TFL3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC171Q6TFL3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC171Q6TFL3 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC171Q6TFL3 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC171Q6TFL3 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC171Q6TFL3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC171Q6TFL3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC171Q6TFL3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC171Q6TFL3 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC171Q6TFL3 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC171Q6TFL3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC171Q6TFL3 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC171Q6TFL3 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms