Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q788

APOA5, Apolipoprotein A-V, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA5Q6Q788 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
APOA5Q6Q788 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
APOA5Q6Q788 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
APOA5Q6Q788 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
APOA5Q6Q788 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
APOA5Q6Q788 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
APOA5Q6Q788 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
APOA5Q6Q788 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
APOA5Q6Q788 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
APOA5Q6Q788 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
APOA5Q6Q788 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
APOA5Q6Q788 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
APOA5Q6Q788 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
APOA5Q6Q788 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
APOA5Q6Q788 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
APOA5Q6Q788 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
APOA5Q6Q788 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
APOA5Q6Q788 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
APOA5Q6Q788 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
APOA5Q6Q788 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
APOA5Q6Q788 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
APOA5Q6Q788 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
APOA5Q6Q788 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
APOA5Q6Q788 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
APOA5Q6Q788 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
APOA5Q6Q788 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
APOA5Q6Q788 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
APOA5Q6Q788 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
APOA5Q6Q788 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
APOA5Q6Q788 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
APOA5Q6Q788 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
APOA5Q6Q788 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
APOA5Q6Q788 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
APOA5Q6Q788 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
APOA5Q6Q788 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
APOA5Q6Q788 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
APOA5Q6Q788 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
APOA5Q6Q788 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
APOA5Q6Q788 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
APOA5Q6Q788 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
APOA5Q6Q788 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
APOA5Q6Q788 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
APOA5Q6Q788 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
APOA5Q6Q788 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
APOA5Q6Q788 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
APOA5Q6Q788 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
APOA5Q6Q788 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
APOA5Q6Q788 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
APOA5Q6Q788 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
APOA5Q6Q788 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
APOA5Q6Q788 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
APOA5Q6Q788 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
APOA5Q6Q788 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
APOA5Q6Q788 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOA5Q6Q788 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOA5Q6Q788 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOA5Q6Q788 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOA5Q6Q788 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOA5Q6Q788 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOA5Q6Q788 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOA5Q6Q788 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOA5Q6Q788 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOA5Q6Q788 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOA5Q6Q788 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOA5Q6Q788 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOA5Q6Q788 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOA5Q6Q788 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOA5Q6Q788 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOA5Q6Q788 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOA5Q6Q788 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOA5Q6Q788 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOA5Q6Q788 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOA5Q6Q788 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOA5Q6Q788 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOA5Q6Q788 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOA5Q6Q788 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOA5Q6Q788 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOA5Q6Q788 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
APOA5Q6Q788 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOA5Q6Q788 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOA5Q6Q788 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOA5Q6Q788 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
APOA5Q6Q788 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOA5Q6Q788 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOA5Q6Q788 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
APOA5Q6Q788 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOA5Q6Q788 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOA5Q6Q788 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
APOA5Q6Q788 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
APOA5Q6Q788 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
APOA5Q6Q788 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
APOA5Q6Q788 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
APOA5Q6Q788 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
APOA5Q6Q788 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
APOA5Q6Q788 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
APOA5Q6Q788 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
APOA5Q6Q788 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
APOA5Q6Q788 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
APOA5Q6Q788 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
APOA5Q6Q788 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms