Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIJ6

FBXO38, F-box only protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO38Q6PIJ6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO38Q6PIJ6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO38Q6PIJ6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO38Q6PIJ6 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO38Q6PIJ6 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO38Q6PIJ6 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO38Q6PIJ6 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO38Q6PIJ6 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO38Q6PIJ6 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO38Q6PIJ6 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO38Q6PIJ6 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO38Q6PIJ6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO38Q6PIJ6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO38Q6PIJ6 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO38Q6PIJ6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO38Q6PIJ6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO38Q6PIJ6 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO38Q6PIJ6 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO38Q6PIJ6 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO38Q6PIJ6 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO38Q6PIJ6 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO38Q6PIJ6 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO38Q6PIJ6 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO38Q6PIJ6 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO38Q6PIJ6 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO38Q6PIJ6 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO38Q6PIJ6 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO38Q6PIJ6 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO38Q6PIJ6 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO38Q6PIJ6 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO38Q6PIJ6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO38Q6PIJ6 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO38Q6PIJ6 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO38Q6PIJ6 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO38Q6PIJ6 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO38Q6PIJ6 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO38Q6PIJ6 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO38Q6PIJ6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO38Q6PIJ6 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO38Q6PIJ6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO38Q6PIJ6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO38Q6PIJ6 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO38Q6PIJ6 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO38Q6PIJ6 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO38Q6PIJ6 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO38Q6PIJ6 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO38Q6PIJ6 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO38Q6PIJ6 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO38Q6PIJ6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO38Q6PIJ6 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO38Q6PIJ6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO38Q6PIJ6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO38Q6PIJ6 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO38Q6PIJ6 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO38Q6PIJ6 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO38Q6PIJ6 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO38Q6PIJ6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO38Q6PIJ6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO38Q6PIJ6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO38Q6PIJ6 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO38Q6PIJ6 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO38Q6PIJ6 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO38Q6PIJ6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO38Q6PIJ6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO38Q6PIJ6 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO38Q6PIJ6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO38Q6PIJ6 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO38Q6PIJ6 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO38Q6PIJ6 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO38Q6PIJ6 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXO38Q6PIJ6 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXO38Q6PIJ6 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXO38Q6PIJ6 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXO38Q6PIJ6 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXO38Q6PIJ6 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXO38Q6PIJ6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXO38Q6PIJ6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXO38Q6PIJ6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXO38Q6PIJ6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXO38Q6PIJ6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXO38Q6PIJ6 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FBXO38Q6PIJ6 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FBXO38Q6PIJ6 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FBXO38Q6PIJ6 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FBXO38Q6PIJ6 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO38Q6PIJ6 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO38Q6PIJ6 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO38Q6PIJ6 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO38Q6PIJ6 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO38Q6PIJ6 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO38Q6PIJ6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO38Q6PIJ6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO38Q6PIJ6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO38Q6PIJ6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO38Q6PIJ6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO38Q6PIJ6 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO38Q6PIJ6 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO38Q6PIJ6 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO38Q6PIJ6 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO38Q6PIJ6 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms