Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD62

CTR9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTR9Q6PD62 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CTR9Q6PD62 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTR9Q6PD62 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTR9Q6PD62 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTR9Q6PD62 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTR9Q6PD62 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTR9Q6PD62 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTR9Q6PD62 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTR9Q6PD62 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTR9Q6PD62 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTR9Q6PD62 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTR9Q6PD62 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTR9Q6PD62 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTR9Q6PD62 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTR9Q6PD62 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTR9Q6PD62 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTR9Q6PD62 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTR9Q6PD62 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CTR9Q6PD62 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CTR9Q6PD62 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTR9Q6PD62 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTR9Q6PD62 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTR9Q6PD62 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTR9Q6PD62 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTR9Q6PD62 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTR9Q6PD62 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTR9Q6PD62 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTR9Q6PD62 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTR9Q6PD62 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTR9Q6PD62 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTR9Q6PD62 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTR9Q6PD62 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTR9Q6PD62 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTR9Q6PD62 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTR9Q6PD62 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CTR9Q6PD62 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTR9Q6PD62 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTR9Q6PD62 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTR9Q6PD62 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTR9Q6PD62 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTR9Q6PD62 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTR9Q6PD62 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTR9Q6PD62 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTR9Q6PD62 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTR9Q6PD62 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTR9Q6PD62 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTR9Q6PD62 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTR9Q6PD62 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTR9Q6PD62 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTR9Q6PD62 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTR9Q6PD62 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CTR9Q6PD62 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTR9Q6PD62 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTR9Q6PD62 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTR9Q6PD62 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTR9Q6PD62 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTR9Q6PD62 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTR9Q6PD62 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CTR9Q6PD62 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CTR9Q6PD62 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CTR9Q6PD62 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTR9Q6PD62 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTR9Q6PD62 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTR9Q6PD62 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTR9Q6PD62 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTR9Q6PD62 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTR9Q6PD62 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CTR9Q6PD62 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTR9Q6PD62 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTR9Q6PD62 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTR9Q6PD62 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CTR9Q6PD62 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CTR9Q6PD62 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTR9Q6PD62 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTR9Q6PD62 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTR9Q6PD62 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTR9Q6PD62 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTR9Q6PD62 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTR9Q6PD62 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTR9Q6PD62 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTR9Q6PD62 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTR9Q6PD62 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CTR9Q6PD62 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTR9Q6PD62 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTR9Q6PD62 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTR9Q6PD62 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTR9Q6PD62 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTR9Q6PD62 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTR9Q6PD62 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTR9Q6PD62 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTR9Q6PD62 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTR9Q6PD62 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTR9Q6PD62 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTR9Q6PD62 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTR9Q6PD62 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTR9Q6PD62 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTR9Q6PD62 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTR9Q6PD62 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTR9Q6PD62 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTR9Q6PD62 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms