Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2D8

XRRA1, X-ray radiation resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRRA1Q6P2D8 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
XRRA1Q6P2D8 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
XRRA1Q6P2D8 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
XRRA1Q6P2D8 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
XRRA1Q6P2D8 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
XRRA1Q6P2D8 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
XRRA1Q6P2D8 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
XRRA1Q6P2D8 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
XRRA1Q6P2D8 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
XRRA1Q6P2D8 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
XRRA1Q6P2D8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
XRRA1Q6P2D8 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
XRRA1Q6P2D8 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
XRRA1Q6P2D8 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
XRRA1Q6P2D8 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
XRRA1Q6P2D8 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
XRRA1Q6P2D8 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
XRRA1Q6P2D8 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
XRRA1Q6P2D8 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
XRRA1Q6P2D8 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
XRRA1Q6P2D8 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
XRRA1Q6P2D8 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
XRRA1Q6P2D8 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
XRRA1Q6P2D8 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
XRRA1Q6P2D8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
XRRA1Q6P2D8 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
XRRA1Q6P2D8 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
XRRA1Q6P2D8 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
XRRA1Q6P2D8 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
XRRA1Q6P2D8 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
XRRA1Q6P2D8 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
XRRA1Q6P2D8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
XRRA1Q6P2D8 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
XRRA1Q6P2D8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
XRRA1Q6P2D8 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
XRRA1Q6P2D8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
XRRA1Q6P2D8 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
XRRA1Q6P2D8 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
XRRA1Q6P2D8 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
XRRA1Q6P2D8 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
XRRA1Q6P2D8 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
XRRA1Q6P2D8 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
XRRA1Q6P2D8 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
XRRA1Q6P2D8 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
XRRA1Q6P2D8 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
XRRA1Q6P2D8 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
XRRA1Q6P2D8 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
XRRA1Q6P2D8 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
XRRA1Q6P2D8 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
XRRA1Q6P2D8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
XRRA1Q6P2D8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
XRRA1Q6P2D8 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
XRRA1Q6P2D8 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
XRRA1Q6P2D8 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
XRRA1Q6P2D8 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
XRRA1Q6P2D8 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
XRRA1Q6P2D8 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
XRRA1Q6P2D8 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
XRRA1Q6P2D8 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
XRRA1Q6P2D8 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
XRRA1Q6P2D8 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
XRRA1Q6P2D8 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
XRRA1Q6P2D8 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
XRRA1Q6P2D8 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
XRRA1Q6P2D8 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
XRRA1Q6P2D8 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
XRRA1Q6P2D8 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
XRRA1Q6P2D8 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
XRRA1Q6P2D8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
XRRA1Q6P2D8 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
XRRA1Q6P2D8 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
XRRA1Q6P2D8 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
XRRA1Q6P2D8 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
XRRA1Q6P2D8 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
XRRA1Q6P2D8 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
XRRA1Q6P2D8 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
XRRA1Q6P2D8 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
XRRA1Q6P2D8 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
XRRA1Q6P2D8 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
XRRA1Q6P2D8 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
XRRA1Q6P2D8 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
XRRA1Q6P2D8 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
XRRA1Q6P2D8 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
XRRA1Q6P2D8 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
XRRA1Q6P2D8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
XRRA1Q6P2D8 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
XRRA1Q6P2D8 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
XRRA1Q6P2D8 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
XRRA1Q6P2D8 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
XRRA1Q6P2D8 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
XRRA1Q6P2D8 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
XRRA1Q6P2D8 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
XRRA1Q6P2D8 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
XRRA1Q6P2D8 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
XRRA1Q6P2D8 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
XRRA1Q6P2D8 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
XRRA1Q6P2D8 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
XRRA1Q6P2D8 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
XRRA1Q6P2D8 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
XRRA1Q6P2D8 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms