Protein–RNA interactions for Protein: Q6H9L7

ISM2, Isthmin-2, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISM2Q6H9L7 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ISM2Q6H9L7 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ISM2Q6H9L7 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ISM2Q6H9L7 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ISM2Q6H9L7 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ISM2Q6H9L7 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ISM2Q6H9L7 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ISM2Q6H9L7 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ISM2Q6H9L7 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ISM2Q6H9L7 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ISM2Q6H9L7 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ISM2Q6H9L7 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ISM2Q6H9L7 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ISM2Q6H9L7 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ISM2Q6H9L7 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ISM2Q6H9L7 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ISM2Q6H9L7 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ISM2Q6H9L7 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ISM2Q6H9L7 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ISM2Q6H9L7 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ISM2Q6H9L7 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ISM2Q6H9L7 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ISM2Q6H9L7 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ISM2Q6H9L7 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ISM2Q6H9L7 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ISM2Q6H9L7 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ISM2Q6H9L7 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ISM2Q6H9L7 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ISM2Q6H9L7 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ISM2Q6H9L7 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ISM2Q6H9L7 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ISM2Q6H9L7 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ISM2Q6H9L7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ISM2Q6H9L7 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ISM2Q6H9L7 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ISM2Q6H9L7 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ISM2Q6H9L7 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ISM2Q6H9L7 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ISM2Q6H9L7 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ISM2Q6H9L7 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ISM2Q6H9L7 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ISM2Q6H9L7 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ISM2Q6H9L7 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ISM2Q6H9L7 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ISM2Q6H9L7 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ISM2Q6H9L7 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ISM2Q6H9L7 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ISM2Q6H9L7 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ISM2Q6H9L7 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ISM2Q6H9L7 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ISM2Q6H9L7 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ISM2Q6H9L7 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ISM2Q6H9L7 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ISM2Q6H9L7 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ISM2Q6H9L7 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ISM2Q6H9L7 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ISM2Q6H9L7 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ISM2Q6H9L7 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ISM2Q6H9L7 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ISM2Q6H9L7 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ISM2Q6H9L7 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ISM2Q6H9L7 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ISM2Q6H9L7 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ISM2Q6H9L7 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ISM2Q6H9L7 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ISM2Q6H9L7 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ISM2Q6H9L7 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ISM2Q6H9L7 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ISM2Q6H9L7 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ISM2Q6H9L7 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ISM2Q6H9L7 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ISM2Q6H9L7 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ISM2Q6H9L7 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ISM2Q6H9L7 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ISM2Q6H9L7 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ISM2Q6H9L7 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ISM2Q6H9L7 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ISM2Q6H9L7 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ISM2Q6H9L7 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ISM2Q6H9L7 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ISM2Q6H9L7 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ISM2Q6H9L7 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ISM2Q6H9L7 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ISM2Q6H9L7 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ISM2Q6H9L7 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ISM2Q6H9L7 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ISM2Q6H9L7 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ISM2Q6H9L7 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ISM2Q6H9L7 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ISM2Q6H9L7 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ISM2Q6H9L7 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ISM2Q6H9L7 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ISM2Q6H9L7 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ISM2Q6H9L7 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ISM2Q6H9L7 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ISM2Q6H9L7 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ISM2Q6H9L7 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ISM2Q6H9L7 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ISM2Q6H9L7 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ISM2Q6H9L7 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms