Protein–RNA interactions for Protein: Q6DKK2

TTC19, Tetratricopeptide repeat protein 19, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC19Q6DKK2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TTC19Q6DKK2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TTC19Q6DKK2 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TTC19Q6DKK2 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TTC19Q6DKK2 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TTC19Q6DKK2 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TTC19Q6DKK2 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TTC19Q6DKK2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TTC19Q6DKK2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TTC19Q6DKK2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TTC19Q6DKK2 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TTC19Q6DKK2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TTC19Q6DKK2 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TTC19Q6DKK2 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TTC19Q6DKK2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TTC19Q6DKK2 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TTC19Q6DKK2 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TTC19Q6DKK2 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TTC19Q6DKK2 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TTC19Q6DKK2 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TTC19Q6DKK2 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TTC19Q6DKK2 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TTC19Q6DKK2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TTC19Q6DKK2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TTC19Q6DKK2 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TTC19Q6DKK2 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TTC19Q6DKK2 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TTC19Q6DKK2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TTC19Q6DKK2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TTC19Q6DKK2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TTC19Q6DKK2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TTC19Q6DKK2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TTC19Q6DKK2 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TTC19Q6DKK2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TTC19Q6DKK2 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TTC19Q6DKK2 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TTC19Q6DKK2 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TTC19Q6DKK2 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TTC19Q6DKK2 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TTC19Q6DKK2 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TTC19Q6DKK2 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TTC19Q6DKK2 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TTC19Q6DKK2 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TTC19Q6DKK2 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TTC19Q6DKK2 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TTC19Q6DKK2 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TTC19Q6DKK2 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TTC19Q6DKK2 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TTC19Q6DKK2 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TTC19Q6DKK2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TTC19Q6DKK2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TTC19Q6DKK2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TTC19Q6DKK2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TTC19Q6DKK2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TTC19Q6DKK2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TTC19Q6DKK2 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TTC19Q6DKK2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TTC19Q6DKK2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TTC19Q6DKK2 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TTC19Q6DKK2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TTC19Q6DKK2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TTC19Q6DKK2 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TTC19Q6DKK2 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TTC19Q6DKK2 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TTC19Q6DKK2 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TTC19Q6DKK2 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TTC19Q6DKK2 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TTC19Q6DKK2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TTC19Q6DKK2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TTC19Q6DKK2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TTC19Q6DKK2 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TTC19Q6DKK2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TTC19Q6DKK2 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TTC19Q6DKK2 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TTC19Q6DKK2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TTC19Q6DKK2 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TTC19Q6DKK2 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TTC19Q6DKK2 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TTC19Q6DKK2 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TTC19Q6DKK2 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TTC19Q6DKK2 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TTC19Q6DKK2 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TTC19Q6DKK2 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TTC19Q6DKK2 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TTC19Q6DKK2 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TTC19Q6DKK2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TTC19Q6DKK2 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TTC19Q6DKK2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TTC19Q6DKK2 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TTC19Q6DKK2 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TTC19Q6DKK2 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TTC19Q6DKK2 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TTC19Q6DKK2 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TTC19Q6DKK2 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TTC19Q6DKK2 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TTC19Q6DKK2 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TTC19Q6DKK2 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TTC19Q6DKK2 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TTC19Q6DKK2 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TTC19Q6DKK2 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms