Protein–RNA interactions for Protein: Q68J44

DUPD1, Dual specificity phosphatase DUPD1, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUPD1Q68J44 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUPD1Q68J44 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUPD1Q68J44 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUPD1Q68J44 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUPD1Q68J44 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUPD1Q68J44 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUPD1Q68J44 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUPD1Q68J44 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUPD1Q68J44 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUPD1Q68J44 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUPD1Q68J44 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUPD1Q68J44 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUPD1Q68J44 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUPD1Q68J44 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUPD1Q68J44 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
DUPD1Q68J44 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DUPD1Q68J44 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DUPD1Q68J44 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DUPD1Q68J44 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DUPD1Q68J44 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DUPD1Q68J44 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DUPD1Q68J44 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DUPD1Q68J44 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DUPD1Q68J44 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DUPD1Q68J44 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DUPD1Q68J44 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DUPD1Q68J44 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUPD1Q68J44 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUPD1Q68J44 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUPD1Q68J44 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUPD1Q68J44 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUPD1Q68J44 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUPD1Q68J44 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUPD1Q68J44 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
DUPD1Q68J44 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUPD1Q68J44 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
DUPD1Q68J44 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUPD1Q68J44 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUPD1Q68J44 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUPD1Q68J44 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUPD1Q68J44 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUPD1Q68J44 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUPD1Q68J44 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
DUPD1Q68J44 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DUPD1Q68J44 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DUPD1Q68J44 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DUPD1Q68J44 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DUPD1Q68J44 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DUPD1Q68J44 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DUPD1Q68J44 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DUPD1Q68J44 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DUPD1Q68J44 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DUPD1Q68J44 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DUPD1Q68J44 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DUPD1Q68J44 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DUPD1Q68J44 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUPD1Q68J44 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUPD1Q68J44 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUPD1Q68J44 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUPD1Q68J44 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUPD1Q68J44 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUPD1Q68J44 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUPD1Q68J44 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUPD1Q68J44 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUPD1Q68J44 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUPD1Q68J44 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUPD1Q68J44 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DUPD1Q68J44 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DUPD1Q68J44 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DUPD1Q68J44 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DUPD1Q68J44 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DUPD1Q68J44 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
DUPD1Q68J44 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DUPD1Q68J44 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DUPD1Q68J44 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DUPD1Q68J44 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DUPD1Q68J44 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DUPD1Q68J44 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DUPD1Q68J44 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DUPD1Q68J44 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DUPD1Q68J44 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DUPD1Q68J44 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DUPD1Q68J44 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DUPD1Q68J44 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DUPD1Q68J44 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DUPD1Q68J44 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DUPD1Q68J44 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DUPD1Q68J44 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DUPD1Q68J44 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DUPD1Q68J44 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DUPD1Q68J44 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DUPD1Q68J44 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DUPD1Q68J44 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DUPD1Q68J44 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DUPD1Q68J44 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DUPD1Q68J44 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DUPD1Q68J44 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DUPD1Q68J44 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DUPD1Q68J44 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DUPD1Q68J44 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.3 ms