Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG16L1Q676U5 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG16L1Q676U5 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG16L1Q676U5 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG16L1Q676U5 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG16L1Q676U5 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG16L1Q676U5 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG16L1Q676U5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG16L1Q676U5 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG16L1Q676U5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG16L1Q676U5 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG16L1Q676U5 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG16L1Q676U5 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG16L1Q676U5 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG16L1Q676U5 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG16L1Q676U5 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG16L1Q676U5 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG16L1Q676U5 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG16L1Q676U5 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG16L1Q676U5 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG16L1Q676U5 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG16L1Q676U5 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG16L1Q676U5 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG16L1Q676U5 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG16L1Q676U5 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG16L1Q676U5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG16L1Q676U5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG16L1Q676U5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG16L1Q676U5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG16L1Q676U5 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG16L1Q676U5 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG16L1Q676U5 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG16L1Q676U5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG16L1Q676U5 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG16L1Q676U5 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG16L1Q676U5 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG16L1Q676U5 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG16L1Q676U5 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG16L1Q676U5 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG16L1Q676U5 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG16L1Q676U5 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG16L1Q676U5 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG16L1Q676U5 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG16L1Q676U5 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG16L1Q676U5 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG16L1Q676U5 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG16L1Q676U5 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG16L1Q676U5 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG16L1Q676U5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG16L1Q676U5 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG16L1Q676U5 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG16L1Q676U5 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG16L1Q676U5 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG16L1Q676U5 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG16L1Q676U5 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG16L1Q676U5 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG16L1Q676U5 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG16L1Q676U5 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG16L1Q676U5 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG16L1Q676U5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATG16L1Q676U5 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATG16L1Q676U5 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATG16L1Q676U5 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATG16L1Q676U5 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATG16L1Q676U5 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATG16L1Q676U5 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATG16L1Q676U5 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATG16L1Q676U5 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATG16L1Q676U5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATG16L1Q676U5 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ATG16L1Q676U5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATG16L1Q676U5 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATG16L1Q676U5 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATG16L1Q676U5 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATG16L1Q676U5 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATG16L1Q676U5 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATG16L1Q676U5 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATG16L1Q676U5 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATG16L1Q676U5 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATG16L1Q676U5 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATG16L1Q676U5 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATG16L1Q676U5 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATG16L1Q676U5 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATG16L1Q676U5 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATG16L1Q676U5 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATG16L1Q676U5 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATG16L1Q676U5 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATG16L1Q676U5 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATG16L1Q676U5 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATG16L1Q676U5 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATG16L1Q676U5 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATG16L1Q676U5 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATG16L1Q676U5 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATG16L1Q676U5 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATG16L1Q676U5 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ATG16L1Q676U5 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ATG16L1Q676U5 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATG16L1Q676U5 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATG16L1Q676U5 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATG16L1Q676U5 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms